“血瘀证”(Blood stasis syndrome,BSS)是常见的传统医学症候,多种疾病伴随着BSS的发生,如不稳定型心绞痛、动脉粥样硬化和心肌梗死等。BSS以血流缓慢和血液瘀滞为特点,同时伴有血液流变学异常、血管内皮细胞损伤和炎症,严重时可导致多器官功能障碍。BSS的治疗多以复方中药为主,但其药效学研究缺乏先进、科学的理论支撑。因此,开发作用机制清晰的BSS治疗药物有重要意义。组学技术作为系统生物学研究的有效工具,能对复杂的生物系统进行自上而下的整体性分析,与中医中“整体”和“症候”理论相一致。组学技术的发展加快了对复杂疾病的诊断,实现了疾病治疗模式从“一种靶标、一种药物”到“多靶标、多组分”的转变,促进了中医药治疗进一步在世界范围内得到认可。大株红景天注射液(Rhodiola wallichiana var.Cholaensis Injection,RWCI)由RWC干燥的根和茎经水提醇沉的方法制备,有活血化瘀、改善血液循环和减轻炎症反应等功效,在中国主要用于预防和治疗心血管疾病(Cardiovascular diseases,CVD)。RWCI可能是通过改善BSS从而起到治疗CVD的作用,但其作用机制有待进一步阐明。本研究通过冰水浴联合肾上腺素复制BSS大鼠模型(模型组),治疗组预防性给予不同剂量的RWCI,收集粪便、血浆及尿液样本,进行基于16S rRNA高通量测序的微生物组学分析和基于高分辨率的UPLC-Q/TOF-MS的代谢组学分析。结果表明:一、对照组、模型组和治疗组大鼠肠道菌群的多样性和丰富度无显著差异,但与对照组相比,模型组肠道菌群的均匀度显著降低,治疗组肠道菌群的均匀度得到明显改善;与对照组相比,模型组肠道菌群结构和分类学组成发生明显变化,其拟杆菌门、TM7菌门、变形杆菌门和放线菌门的相对丰度存在显著差异,治疗组这4个菌门的相对丰度明显改善;LEfSe分析及ROC曲线验证结果发现,与对照组相比,模型组肠道菌群中3个菌属(双歧杆菌属、肠球菌属和梭菌属)和4个菌种(假长双歧杆菌、瑞士乳酸菌、罗伊氏乳杆菌和黏液真杆菌)的相对丰度显示出显著差异,治疗组肠道菌群中这3个菌属和4个菌种的相对丰度显著改善;PICRUSt功能预测结果表明,BSS大鼠肠道菌群失调可能导致免疫系统及代谢途径相关的基因丰度发生变化。二、代谢组学研究通过OPLS-DA模型在血浆及尿液样本中分别鉴别出14和33种差异代谢物,涉及9条紊乱的代谢通路,其中5条代谢通路(花生四烯酸代谢、亚油酸代谢、α-亚麻酸代谢、视黄醇代谢和类固醇激素生物合成)与BSS发生发展及RWCI干预显著相关。三、基于16S rRNA测序和UPLC-Q/TOF-MS技术获得的微生物组学数据和代谢组学数据,进行双组学关联分析,发现BSS大鼠肠道菌群结构和组成的变化与机体花生四烯酸代谢和类固醇激素生物合成途径存在显著相关性。综上所述,BSS大鼠肠道菌群的结构和组成以及机体的代谢模式发生明显的变化,并且两者存在显著相关性;RWCI可能通过改善肠道菌群的分布结构,进而调节机体代谢模式,对BSS起到治疗作用。