【摘 要】
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目的:本研究旨在探讨螺旋卷曲结构域含蛋白69(CCDC69)与乳腺癌的关系,分析CCDC69的差异表达与乳腺癌的临床病理的关系,并初步探索CCDC69影响乳腺癌的预后的机制。方法:利用GEO数据库中乳腺癌的表达谱芯片数据集筛选出乳腺癌与乳腺正常组织中显著差异表达的基因;通过Onco Lnc挑选出影响乳腺癌患者预后的基因,结合文献检索选择CCDC69作为研究基因,检测GEPIA中与CCDC69相关系
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目的:本研究旨在探讨螺旋卷曲结构域含蛋白69(CCDC69)与乳腺癌的关系,分析CCDC69的差异表达与乳腺癌的临床病理的关系,并初步探索CCDC69影响乳腺癌的预后的机制。方法:利用GEO数据库中乳腺癌的表达谱芯片数据集筛选出乳腺癌与乳腺正常组织中显著差异表达的基因;通过Onco Lnc挑选出影响乳腺癌患者预后的基因,结合文献检索选择CCDC69作为研究基因,检测GEPIA中与CCDC69相关系数大于0.8的相似基因,在Fun Rich3.1.3上对CCDC69及其相似基因进行富集分析探索CCDC69作用于乳腺癌的信号通路;通过q RT-PCR检测24例乳腺癌患者的乳腺癌组织及其癌旁组织的CCDC69的表达,采用免疫组织化学方法检测101例乳腺浸润性癌患者肿瘤组织中CCDC69及其相似基因之一含SH3结构域的蛋白1(SORBS1)的表达;并结合临床病例信息探讨CCDC69的差异表达与乳腺癌的临床病理的关系。结果:在GEO数据库中,以Log2-fold change≤-2且P≤0.05为条件筛选出CCDC69,通过q RT-PCR检测证实了相较于癌旁组织,CCDC69在乳腺癌组织中显著低表达(P=0.0002),差异具有统计学意义。在Onco Lnc中作CCDC69影响乳腺癌患者生存率的Kaplan plot图显示CCDC69低表达水平的乳腺癌患者总体生存率更低(Logrank P-value=0.000698)。通过基因富集分析发现CCDC69及其相似基因与脂肪分化显著相关,其中大部分基因跟过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路相关,而且大量研究证实PPAR信号通路与脂肪分化相关。免疫组化结果显示CCDC69与SORBS1的表达呈正相关性(P=0.001),与Ki67表达呈负相关性(P=0.001)。LSD多重比较显示在三阴型乳腺癌中CCDC69的阳性表达率更低,与Luminal A型、HER2型乳腺癌相比差异具有统计学意义(P=0.014;P=0.034)。而相较于非三阴型乳腺癌组,三阴型乳腺癌组的CCDC69阳性表达率更低(P=0.0362)。在三阴型乳腺癌中出现无病生存期(DFS)事件的患者的CCDC69均呈低表达水平。结论:CCDC69低表达患者的乳腺癌细胞增殖能力更强、病理分型更差、临床预后更差。CCDC69可以通过调控PPAR信号通路影响乳腺癌的预后,是乳腺癌的潜在治疗靶点。
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