论文部分内容阅读
该文采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对四个地理品系的褶皱臂尾轮虫(Brachionus plicatilis)种群的遗传多样性进行了研究.四个地理品系分别为大连、盘锦、东营、天津.实验样品的来源为野外采集轮虫卵进行实验室培养获得新鲜的轮虫样品,用酚-氯仿抽提法获得DNA,在优化的RAPD反应条件下,即94℃预变性5min,然后进入PCR循环:94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸1min;共45个循环后,在72℃延伸10min.该文随机选定了30个10bp的引物进行PCR扩增,其中26条引物所得的扩增带带型清晰而且重复性好.将这26条随机引物产生的谱带进行DNA多态性分析,26条引物共检测出311个位点,片段长度在190-2000bp.大连品系轮虫种群产生226个位点,其中有196个多态性标记;盘锦品系产生165个位点,其中有150个多态性标记;东营品系产生207个位点,其中有182个多态性标记;天津品系产生180个位点,其中有153个多态性标记.四个品系之间的共享度分别为:大连与盘锦品系的共享度为0.3826,大连与东营品系的共享度为0.3467,大连与天津品系的共享度为0.3447--为共享度最小的两个品系;盘锦与天津品系的共享度最大为0.4069.四个品系的Nei遗传距离由小到大分别为:天津与盘锦品系为0.4215,天津与东营品系之间为0.4465;盘锦与东营品系之间为0.4498;大连与盘锦品系之间为0.4660;大连与东营品系之间为0.4852;大连与天津品系之间为0.4873.由Jaccard遗传距离的大小排序与此相同.可见,大连与天津品系的遗传距离最大,亲缘关系最远;盘锦与天津品系之间的遗传距离最小,亲缘关系最近.UPGMA聚类可得:盘锦品系与天津品系聚在一起,然后与东营品系聚在一起,最后与大连品系聚在一起.