现代医药物流运作方式正从传统的批发模式向供应链的集约化管理模式发展,建立起以物流中心为平台、与制造商及其他供应商(上游企业)和药品零售商及其他分销商(下游企业)紧密相连的一种面向市场的供应系统。随着一系列“医改新政”的陆续推行,将进一步促进医药流通批发企业向医药物流业实施战略性转型,这必然对现有的税收管理提出新的挑战。研究新形势下的医药物流业的税收管理,既可以丰富和发展税收管理理论,也可以为税务部门提高税收征管效能提供决策参考。因此研究这一问题具有重要的理论价值和现实意义。本文通过对樟树市医药物流业税收管理存在问题、问题形成的原因进行分析,提出优化纳税服务、信息管税、以及实施税源专业化的措施,在结构上共分六章。其中：第一章为导论；第二章为医药物流业概述；第三章为樟树市医药物流业税收管理的现状及分析；第四章为樟树市医药物流业税收管理存在问题的对策分析；第五章为案例分析；第六章为结论与展望。针对樟树市医药物流业税收管理存在的问题,本文最后提出增强服务意识、优化纳税服务、大力推进纳税服务信息化可以有效促进纳税遵从。实施信息管税,充分利用现代信息技术手段,解决征纳双方信息不对称问题,对涉税信息进行采集、分析、利用,完善,加强业务与技术的融合,是全而提高税收征管工作水平的必由之路。对医药物流业实施税源专业化管理,加强税源监控,逐步建立一套操作性强、行之有效、切合行业实际的税源管理办法,是国税部门培植税源,促进地方产业经济发展的重要举措。