耐辐射球菌recQ及相关基因的生化和突变分析

来源 :浙江大学农业与生物技术学院 浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hf4057
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
耐辐射球菌能在电离紫外辐射、化学毒剂、热、干燥等极端环境下存活。这得益于它不同寻常的DNA修复能力,特别是对电离辐射导致的双链断裂的重组修复。这种难以置信的DNA修复能力令D.radiodurans成为很好的模式生物。尽管如此,该细菌的修复机理至今仍知之甚少,需要进一步研究。   RecQ家族的DNA解旋酶对基因组稳定性的维持起到必要的作用。耐辐射球菌中的RecQ是RecQ家族中特别的一员,不同于其他物种来源RecQ的是,它在C端有着三个串联HRDC结构域。而与RecQ蛋白互作的单链DNA结合蛋白(SSB)在所有的DNA代谢进程中非常重要,包括DNA复制,重组和修复。与其他细菌SSB蛋白均以同源四聚体行使功能不同,耐辐射球菌SSB是同源二聚体的,每个单体含有两个OB fold。本文主要系统研究耐辐射球菌RecQ和SSB蛋白的生化活性及突变分析系统分析。具体结果如下:   1.首先构建了RecQ突变株。RecQ突变株对辐照、UV、过氧化氢和丝裂霉素C均非常敏感。通过补偿突变株以RecQ的不同部分,发现解旋酶和三个HRDC结构域对DNA损伤抗性均为不可缺少。解旋酶结构域对解旋酶活性和ATP酶活性均为必需,而三个串联HRDC结构域则促进了这些活性。   2.基于其晶体结构构建四个SSB截断突变体。凝胶过滤结果表明DrSSB、DSCT和DSCC是同源二聚体,而DSN和DSNC是单体。这支持了N端在二聚体形成过程中起主要作用的假设。我们使用EMSA和FRET对每个OBfold在DNA结合中的作用进行了探索。   3.在uvsE uvrA1 uvrA2的基础上,敲除了recQ构建了四突变株。用rpoB/Rif系统测量了野生株、突变株recQ(MQ)、uvsE uvrA1 uvrA2(TNK006),和uvsE uvrA1 urrA2 recQ(TQ)的突变频率和突变率。然后分离Rif的突变体,并对rpoB基因进行了测序。结果表明,recQ通过与uvsE uvrA1 uvrA2的互作参与了紫外损伤修复途径。   4.测定在不同利福平浓度下(从5到50μg/ml的浓度梯度)的突变率。耐辐射球菌在5μg/ml利福平筛选压力下的突变率显著高于其在25μg/ml和50μg/ml下的突变率。耐辐射球菌突变的利福平浓度依赖效应,不仅表现在突变率上,也表现在突变谱上。我们推测,在低利福平浓度下,耐辐射球菌重点防止碱基替换突变,因为活性氧ROS主要造成氧化碱基损伤。   5.使用DNA芯片技术和生化实验来鉴定耐辐射球菌β亚基中突变是如何通过调控其他基因转录来改变生长速度的。可从这些结果中分析β亚基中突变是如何调控其他基因转录的分子机制。   综上所述,RecQ解旋酶的三个HRDC结构域不仅对DNA损伤抗性不可缺少,对解旋酶和ATPase活性也很重要。其互作蛋白SSB的ssDNA结合活性需要两个OB fold的互作。突变分析系统的研究表明了RecQ与紫外损伤修复系统的互作关系。耐辐射球菌突变的利福平浓度依赖效应,不仅表现在突变率上,也表现在突变谱上。芯片分析则展示了β亚基中突变是如何调控其他基因转录。
其他文献
四氯化钛是生产高档钛白和海绵钛的中间体,在钛资源的转化利用过程中具有非常重要的地位。目前的主流氯化工艺均要求钛渣原料中钙镁含量不高于4%,常规沸腾床氯化要求钙镁含量低
多组分液相分子扩散系数在化工过程和设备设计中有很重要的作用。随着非平衡级模型在分离设备计算中的应用,多组分液相分子扩散系数的重要性日趋明显。 Taylor分散法是一种
既往有关HIV及机会性感染机制的研究集中在获得性免疫方面,但以CD4+T细胞数量减少引起的获得性免疫功能缺陷不能完全解释HIV感染促进其机会性感染如结核分枝杆菌(Mtb)感染的
会议
2012年9月,中东地区呼吸综合症(MERS)首次在中东地区发现以来,该地区一直被不断发生的疫情所笼罩.截止到目前为止:已有1517人感染,其中539人死亡,致死率高达35.5%,远高于2003
会议
会议
The central nervous system plays a predominant role in organisms associated with cognition and higher-order functions,which is key to their normal behavior and
会议
流感病毒,是有包膜的分节段负链单链RNA病毒,是正粘病毒科(Orthomyxoviridae)的代表种.甲型流感病毒(IVA)的感染范围最广,它的基因组包含8个负义单链RNA片段,其中片段8最短,
会议
  The porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV)RNA endoribonuclease nsp11 belongs to the XendoU superfamily,and plays a crucial role in viral
会议
直接二甲醚燃料电池(Direct Dimethyl ether Fuel cell,以下简称DDFC)具有类似氢气无需泵和高于甲醇的能量密度,安全无毒,作为便携电子产品的电源具有独特的优势.目前国内外
废水处理是环境工程中的一个重要课题,当前的水处理有物理法、化学法、物理化学法和生物法四大类,而在众多的水处理方法中,絮凝法由于设备简单、维护操作易于掌握、特定处理