鉴定复杂体系中的蛋白质时，随着样品复杂程度和实验流程的不同，往往生成几万到几十万张数量不等的二级谱图，其中只有10％～20％的谱图与肽段序列形成正确匹配，余下的二级谱图很多质量较差，导致大量随机匹配产生的假阳性肽段鉴定结果，并且阳性结果与假阳性结果之间有较大的重叠，难以直接区分，相应引起假阳性蛋白质鉴定结果的出现。事实上，蛋白质组学相关文献中报道的规模化蛋白质鉴定数据，都不同程度的存在错误的鉴定结果，甚至，一些在生物质谱方面缺乏经验的实验室，在鉴定蛋白质时认为所有的质谱鉴定结果都是准确无误的，不对其做进一步的处理。 搜索“逆转数据库”法，能够降低蛋白质串联质谱鉴定数据的假阳性率，提高数据的可靠性，并且使得来自不同技术路线、不同质谱仪器以及不同实验室的数据具有可比性。本研究对搜索“逆转数据库”法应用于肝脏样本的分析进行了初步考察。基于数据库搜索引擎SEQUEST软件的高通量蛋白质鉴定中，肽段的Xcorr值受肽段序列长短的影响，因此对于不同长度的肽段设置相同的判据显然是不合适的。本研究根据肽段的长度对Xcorr值进行校正，校正后，18种标准蛋白质的肽段鉴定数目，在+1，+2，+3电荷状态下同时考虑Xcorr和DetaCn时，分别增加了13.5％，17.5％和13.6％。时，肽段的整体鉴定数目增加了15.8％。实验证明，使用搜索“逆转数据库”法同时对Xcorr进行校正，能够增加肽段的鉴定数目，并且降低数据的假阳性率和假阴性率。