在物种的进化过程中,我们对于哺乳动物染色体的同源共线区的保守性以及高频率的断裂点重复等这些特征的研究不够深入。为了更好的理解影响染色体结构进化的动力,在分辨率为500Kbp的基础上,我们比较了12个脊椎动物(人类,黑猩猩,猩猩,恒河猴,小鼠,大鼠,牛,猪,狗,马,负鼠,鸡)的同源共线关系。通过分析,在所有的基因组的配对比较中识别了2092个同源共线区块(HSBs)和1041个染色体进化断裂区(EBRs)。在对大于3Mbp的多物种同源共线区块和小于1Mbp的染色体进化断裂点区域内及其附近的基因进行基因本体论注释分类后得到以下结果,多物种同源共线区块内及其附近的基因一般都与生物体中央神经,信号转导以及其他生物体发育有关,而进化断裂点区域内及其附近的基因则与生物体的功能适应性及反应有关。