随着社会领域对非政府组织开放程度的加大,在华境外非政府组织的影响力不断增强。然而,现阶段我国针对在华境外非政府组织的法律法规尚呈现滞后性,大多数在华境外非政府组织难以通过注册获得合法身份,导致其正常活动受到限制。同时,政府行政管理效率较低、部门之间权责不明、与境外组织沟通与合作不畅等问题也日益突显。因此,改善非政府组织注册制度已成为当务之急。一方面,良好、健全的注册制度是实现国家与在华境外非政府组织互利共赢和长久稳定发展的保障,也是提高政府行政效率,实现社会利益最大化的重要途径。另一方面,加强在华境外非政府组织的监管,可以有效降低政治渗透性境外组织危害国家安全的风险,确保社会稳定。基于此,本文对在华境外非政府组织注册制度展开研究。首先,本文通过分析在华境外非政府组织注册现状得出,立法相对滞后,政府与境外组织关系不明朗、服务双方信息不透明、政府相关部门职能划分错位等是导致在华境外非政府组织注册条件界定模糊、在华境外非政府组织注册流程规定不明、政府与在华境外非政府组织双方缺乏合作、在华境外非政府组织的注册管理行政效率低等问题的主要因素。其次,总结了国内外政府对在华境外非政府组织注册工作的探索和经验,得出登记备案制与分类管理制比现阶段的双重管理制更适合并有利于政府与组织的共同发展。最后,本文从完善相关法律、构建沟通与对话机制、设立专门性监管机构与数据库系统、简政放权与分类管理有机结合以及登记备案制与分类管理有机结合等五个层面提出了对策建议。