香榧嫁接过程中ARF功能及转录组测序初步分析

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香榧(Torreya grandis‘Merrillii’)为榧树(Torreya grandis)中经人工选育后嫁接繁殖栽培的优良品种。香榧种子是我国特有的珍稀干果,是山区农民的主要经济来源之一。目前香榧栽培存在幼苗生长缓慢,造林成活率低等问题。嫁接作为一种广泛应用的园艺手段,可以扩大香榧的栽培规模,提高造林成活率。本文以香榧嫁接苗为试验材料,通过不同植物生长调节剂和遮荫处理,研究不同处理、嫁接不同部位的内源激素含量,克隆香榧的生长素响应因子ARF,筛选嫁接相关的代谢通路,分析香榧嫁接过程中ARF基因家族的表达变化,为揭示ARF调控香榧嫁接的分子机制提供一定的理论参考。主要研究结果如下:1、利用酶联免疫法测定植物内源激素含量的变化,测定指标为IAA、GA、CTK、ABA四项,发现随着嫁接时间的延长,对照组中IAA和GA含量呈现先上升后下降的趋势,ABA含量呈现先下降后上升趋势而CTK含量则逐渐上升;外施IAA一定程度上诱导内源CTK,GA和IAA含量表达增加,而ABA含量减少;外施NPA则使四项激素含量都明显下降,表明外施NPA对激素表达有抑制作用;遮荫处理条件下,ABA和GA的含量有一定的提升,但CTK和IAA的含量总体有所下降。2、克隆得到TgARF cDNA开放阅读框全长为2676bp,预测编码891个氨基酸,与15个植物的ARF基因比较,发现与挪威云杉的亲缘关系最近,其次是黄杉。3、利用qRT-PCR研究TgARF基因在不同处理下转录水平的变化,发现对照组接穗中TgARF基因在嫁接后3天表达量下降,嫁接后7天上升并达到最大值,14天又下降;在砧木中则呈现稳定上升趋势,在嫁接后14天表达量达到最大值。激素和遮荫处理对TgARF基因的表达也存在一定影响,遮荫处理明显加大了表达量的变化幅度。4、基于转录组分析香榧嫁接过程中基因的表达变化,共得到17.8亿个短片段,拼接得370391个独立基因;对表达的差异基因进行分析,分别在嫁接7天和14天的样本中发现84468和135625个差异表达基因,这些基因参与多条代谢通路;筛选得到344个ARF注释的基因,对其在嫁接过程中的表达变化进行初步分析,挑选其中12个ARF基因进行转录水平的表达变化验证,发现其参与香榧嫁接过程,但在砧木和接穗中的表达变化模式存在一定差异。
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