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随着社会的发展和人口的增加,鸡的养殖数量越来越多,分布区域也越来越广,为了适应不同环境与气候条件,鸡群通过不断的自然选择和人工选择,鸡的羽色日渐丰富起来。人们对鸡羽毛颜色也具有偏好性,而研究鸡羽色表型与基因型之间的联系,就是为了能够选育出符合消费者喜好的产品,以此满足市场的需求。本试验对广元灰鸡(灰羽),旧院黑鸡(黑羽),罗曼蛋鸡(白羽),芦花鸡(横斑羽)以及HS1(麻羽)等几种不同羽色鸡群各50个体的MC1R、TYR和ASIP基因多态性进行分析,并找到和鸡羽毛颜色相关的SNPs,之后运用RT-PCR技术分析几个基因在不同羽色广元灰鸡中各组织的表达量,探讨MC1R、TYR和ASIP基因在鸡羽毛颜色的形成分化过程中扮演的重要角色,为广元灰鸡的羽色选育提供一些理论依据。试验结果如下:(1)在MC1R基因上共发现3个突变位点,分别是T398A、T637C和G920C,通过翻译后发现,三个SNPs全部为错义突变,这些突变位点均与鸡羽色的形成有较强相关性,其中T398A突变导致第133位亮氨酸被谷氨酰胺取代(Leu133Gln),该位点在黑羽和麻羽群体中没有发现;T637C突变导致第213位半胱氨酸被精氨酸取代(Cys213Arg);G920C突变导致第307位精氨酸被脯氨酸取代(Arg307Pro),该位点在黑羽群体中没有出现。(2)在TYR基因外显子1上检测到3个突变位点,分别是C47G,T120C和T172C,这些突变位点均与鸡羽色的形成有较强相关性。通过翻译后发现,三个SNPs位点中,T120C为同义突变,且该突变在黑羽群体中没有发现,另外两个为错义突变,其中C47G突变导致第16位脯氨酸被精氨酸取代(Pro16Arg),没有在横斑羽的鸡群体中发现该突变位点,T172C突变导致第58位苯丙氨酸被亮氨酸取代(Phe58Leu),且该突变在横斑羽群体中呈现完全多态现象。(3)在ASIP基因外显子3上发现一个突变位点T168C,该突变属于同义突变,而且并未出现在白羽鸡群体中。(4)在皮肤和毛囊组织中,灰黄群体MC1R和TYR基因表达量都是最低的,而黑色群体表达量都是较高的,灰黄群体中ASIP基因表达量是最高的,而黑色群体表达量是最低的;垂体组织与皮肤毛囊组织中的基因表达量分布比较相似;基因在肝脏和肾脏组织中的表达量没有明显的差异。综上所述,MC1R、TYR和ASIP基因的突变与鸡的羽色表型有一定相关性,是影响鸡羽色性状的重要基因;从基因表达差异来看,MC1R基因和TYR基因是广元灰鸡深色羽色产生分化的关键基因,广元灰鸡浅色羽色产生的关键基因是ASIP基因,同时ASIP基因与MC1R基因和TYR基因存在互为抑制作用,这为今后广元灰鸡的羽色选育提供了一定理论基础。