随着知识经济时代的到来,创新正日益成为地区经济发展与社会进步的重要推动力。对于不同创新发展水平的地区来说,选择什么样的创新模式是地区在科技发展规划和科技资源配置中必须要解决的问题。科技资源是开展科技活动,实现科技创新的基本条件。不同地区科技资源配置存在差异性,科技创新产出也呈现多元化的特征。本文以科技投入产出差异化为基础,对区域创新模式进行深入研究,为地区创新战略选择提供支持和借鉴。本文首先从科技人力资源、科技活动经费和科技基础条件等方面对科技资源的相关概念进行了梳理。并从规模性和结构性的角度,对地区科技资源投入的差异性进行分析,主要反映在资源多样化、投入主体多元化、重视资源投入效率、向条件和环境有利地区集聚等特征。从论文产出、专利产出和高技术产业产出三方面,对科技创新产出水平进行了分析；虽然我国科技创新产出整体水平稳步提高,但各地区之间仍存在较大差距。运用单相关系数对科技资源投入与产出的相关性进行了简要分析。运用数据包络分析方法对科技资源投入和科技创新产出的有效性进行分析,结果显示我国仍然有三分之二的地区没有达到DEA综合有效,存在科技资源利用率不高,投入规模不足等问题。最后将科技投入和产出的各项指标分别进行综合,结合探索性空间数据分析方法和GeoDa软件,运用空间自相关Moran’s I指数对地区科技投入和产出进行了集聚性分析。根据不同集聚类型,构建创新模式框架体系；并针对投入产出有效性的情况,提出有发展重点的创新模式。