【摘 要】
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鸡传染性支气管炎（Infectious bronchitis,IB）是由鸡传染性支气管炎病毒（Infectious bronchitis virus,IBV）引起的一种急性高度接触性、对养殖业造成巨大经济损失的病毒性疾病。圆圈病毒3型（Gyrovirus 3,Gy V3）是引起鸡传染性病毒性腺胃炎（Transmissible viral proventriculitis,TVP）的病原之一。鸡细小
【基金项目】
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福建省农业高质量发展超越创新工程（5511创新工程）项目；
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鸡传染性支气管炎（Infectious bronchitis,IB）是由鸡传染性支气管炎病毒（Infectious bronchitis virus,IBV）引起的一种急性高度接触性、对养殖业造成巨大经济损失的病毒性疾病。圆圈病毒3型（Gyrovirus 3,Gy V3）是引起鸡传染性病毒性腺胃炎（Transmissible viral proventriculitis,TVP）的病原之一。鸡细小病毒（Chicken parvovirus,Ch PV）是导致鸡的发育障碍与矮小综合征（Runting stunting syndrome,RSS）的病原之一。近年来,Ch PV感染和Gy V3感染在我国鸡群中广泛流行,且IBV发生时有发生,然而目前福建省内关于Gy V3和Ch PV的分子流行病学研究尚未见报道。基于此,本研究于2020年9月——2021年12月在福建省南平市、福州市、龙岩市随机选取55个鸡场共收集病料535份,通过PCR或RT-PCR对这3种病原进行检测;并从中选取典型阳性样品分别进行IBV的S1基因、Gy V3 VP2基因、Ch PV NS1基因克隆、测序和分析,同时进行上述3种病毒的分离鉴定。检测结果显示:IBV阳性场为2个,场阳性率为3.64%（2/55）,检测到阳性样本3份,样本阳性率为0.56%（3/535）;Gy V3阳性场为22个,场阳性率为40%（22/55）,检测到阳性样本116份,样本阳性率为21.68%（116/535）;Ch PV阳性场为19个,场阳性率为34.55%（19/55）,检测到阳性样本154份,样本阳性率为28.78%（154/535）。流行病学调查结果表明,在随机收集病料的情况下,IBV检出率较低;Ch PV和Gy V3检出率较高,表明Ch PV感染与Gy V3感染在福建省内鸡场广泛流行。本研究共获得3株IBV分离株（其中2株来自福州,1株来自南平）的S1基因、11株Gy V3（其中9株来自龙岩,2株来自南平）VP2基因和9株Ch PV（2株来自南平,2株来自福州,5株来自龙岩）NS1基因。IBV S1基因遗传进化树分析结果显示,分离株IBV-FZ-01和IBV-FZ-02为LX4/QX型;南平地区分离到的IBV毒株IBV-NP-01与广西南宁参考株以及江苏连云港参考株亲缘关系较近,然而不属于现已知的任何一个基因型。本研究结果表明,目前省内的IBV类型除了QX型外,已出现了新的变异株;Gy V3 VP2基因遗传进化树分析结果表明所有分离株均与Gy V3参考株处于同一分支;11株分离株的VP2基因与8株参考株的核苷酸同源性在84.8%～99.8%之间。实验结果表明,Gy V3 VP2基因较为保守,不同地区毒株的VP2基因差别不明显;Ch PV NS1基因遗传进化树分析结果显示:来自三个地区的所有分离株都与广西参考株亲缘关系较近;龙岩分离株LY-05与3株韩国参考株处于同一分支;分离株LY-03与来自匈牙利的参考株ABU-P1亲缘关系较为接近;9株分离株与参考株之间的核苷酸同源性为90.8%～99.9%。本研究结果说明:Ch PV NS1基因之间的核苷酸同源性以及亲缘关系的远近不受地域差异的影响。综上所述,通过对535份临床样本进行检测,发现福建省部分地区存在IBV（QX/LX4型）以及IBV的变异株,同时还证实,Gy V3和Ch PV在福建省内部分地区的鸡场中广泛存在。本研究也发现,Gy V3的VP2基因保守性较高,地域差异不会导致VP2基因的变化。此外,对福建省部分地区的Ch PV的NS1基因遗传分析表明,它与世界各地流行的其他Ch PV株具有高度的相似性。本研究为福建省的IBV、Gy V3和Ch PV感染的防控与后续研究提供了参考。
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