由于人类活动频繁和高度开发，紫果云杉天然林的面积持续减少，破碎化的程度不断提高。自上世纪50-70年代四川西部大规模砍伐活动以来，川西米亚罗地区的紫果云杉天然林已几乎消失殆尽，只零星存在极少量的孤立木；其它保护区以外的天然林也濒临消亡。原本为川西暗针叶林顶级优势树种的紫果云杉，现已面临多样性丧失、大面积消亡的危险。为了保护现有的紫果云杉天然种群，并进一步开展合理规划和科学利用，研究紫果云杉种群的变型变异和多样性水平是非常重要而关键的工作。　　 在查阅文献记录、植物志和野外勘测的基础上，在紫果云杉天然种群的全分布区内选取9个种群作为研究对象。共测量1422个球果样品，种鳞、种翅和种子各4266个。采用一般线性模型、巢式方差设计分析、相关分析和聚类分析等分析方法，研究了紫果云杉天然种群的表型多样性、变异特征，及其与地理生态因子之间的关系。主要结果如下：　　 1．运用巢式设计方差分析研究紫果云杉表型性状变异来源，紫果云杉12个表型性状的平均表型分化系数为35．18％，群体内的变异为64．82％，说明紫果云杉群体内多样性程度大于群体间多样性，表型变异以群体内为主。　　 2．紫果云杉在不同种群内每一性状都存在着广泛差异。在9个种群中，巴西（BX）种群的表型变异最丰富，两河（LH）种群表型多样性程度较低。13个表型性状中，球果干重变异值最大，种鳞宽稳定性较高。　　 3．紫果云杉表型性状间的相关分析结果表明，种鳞长和球果干重是紫果云杉较为关键和重要的表型性状，对表型性状的测定效率有着极为重要的影响。　　 4．紫果云杉表型与生态因子相关分析表明，影响紫果云杉表型性状的最主要地理生态因子是经度，纬度、海拔和年均降水量其次，温度的影响最小。　　 5．紫果云杉种群表型特征基本上按地理距离而聚类，变异受十分强烈的地理阻隔的影响（k=0．727，p<0．01，R2=0．529）。　　 6．紫果云杉总的地理变异在其自然分布区中呈现出以大姓、牟尼沟和毛尔盖为中心的表型变异的丰集区和分化中心。