基因芯片技术是二十世纪九十年代发展起来的一种前沿生物技术，具有高效、快速、高通量和半定量的特点。本文尝试将该技术应用于中药药物作用机制及毒物作用机制的研究。　　 药物作用机制研究是通过建立大鼠心肌梗死(MI)模型，用基因表达谱分别扫描心肌梗死过程中以及药物干预后基因表达的变化，筛选出差异基因。并对差异表达基因进行聚类分析、GO功能富集分析和Pathway富集分析，研究心肌梗死相关的可能作用机制，为心肌梗死的防治提供了理论依据。根据基因功能注释结果，从差异表达基因中寻求麝香保心丸作用的多个基因，这些基因主要和能量代谢、整联蛋白、催化活性、氧化应激、肌动蛋白、激肽原酶激活、胰岛素生长因子相关，从而验证了麝香保心丸(HMP)的“多靶点“性。从芯片分析结果中筛选Fn1、Tpm1、Fndc1基因作为目的基因进行重点研究，RT-PCR实验验证了芯片结果的可靠性。而Tpm1基因在不同组之间的变化说明了麝香保心丸作为心肌梗死急救药可能的作用机理。　　 研究也将基因芯片用于毒物作用机制的研究。即用不同剂量三聚氰胺喂食SD大鼠后，用基因芯片研究其肾毒性作用机制。聚类分析结果发现，高剂量三聚氰胺会导致严重的肾毒性影响，金属离子结合是其中一种很重要的功能。