自从专利制度诞生以来,利益平衡一直是其基本原则,专利权保护与限制之间的平衡是其合法存在的基础。随着全球经济一体化的不断加深和发达国家越来越明显的专利技术优势,专利制度越来越呈现出关注私人利益的趋势,利益平衡的天平越来越向专利权人倾斜,在药品专利领域也是如此。而药品作为与社会公众利益紧密相关的物品,在这种利益失衡的情况下,引来了人们的高度关注。在本文第一部分,首先分析了专利制度中构建利益平衡机制时需要考虑的两个方面:“界定专利的合理保护范围和期限”和“界定专利权的合理行使”,接着分析了药品发明的特点及其专利制度中存在的利益冲突。在本文第二部分,分析了包括TRIPS协议在内的与药品专利密切相关的国际协议,讨论了南北双方围绕药品专利的利益博弈。在本文第三部分,分析了国际法与药品专利的三个热点问题:强制许可、平行进口和Bolar例外,并结合我国专利立法情况,给出了修改专利法的建议。在本文第四部分,围绕如何构建我国药品专利的利益平衡机制,首先分析了我国医药行业的现状和我国药品专利制度的沿革,然后给出了笔者的建议。