【摘 要】
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该研究应用RAPD标记对21个不同棉花种质资源进行PCR扩增,并对其进行多态性分析、遗传距离计算和聚类分析.多态性分析表明利用14个RAPD标记获得了649个等位基因,其中116个具有
【出 处】
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中国农业科学研究院 中国农业科学院
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该研究应用RAPD标记对21个不同棉花种质资源进行PCR扩增,并对其进行多态性分析、遗传距离计算和聚类分析.多态性分析表明利用14个RAPD标记获得了649个等位基因,其中116个具有多态性,多态率为17.9﹪.遗传距离分析结果表明21个供试的棉花种质资源的平均遗传距离为0.403,海岛棉种内的平均遗传距离为0.241,陆地棉种内的平均遗传距离为0.366,彩色棉品种间的平均遗传距离为0.281,海岛棉与陆地棉种间的平均遗传距离为0.48,海岛棉与彩色棉之间的平均遗传距离为0.478,彩色棉与其它陆地棉品种间的平均遗传距离为0.430.表明棉花种间亲源关系较远,种内亲源关系较近.中棉、草棉与海岛棉和陆地棉四个栽培种间的平均遗传距离分别为0.4317、0.3946、0.4193、0.4318,海岛棉与草棉的A染色体组较为接近,而陆地棉与中棉的A染色体组之间相近似.表明利用RAPD标记,通过遗传距离和聚类分析可以阐明棉花种质的亲缘关系,反映出了异源四倍体A基因组与二倍体A基因组的进化关系.该研究应用简单序列重复(simply sequence repeat,SSR)、简单序列重复间区(inter-simple sequence repeat,ISSR)及随机扩增多态性DNA(random amplifiedpolymorphism DNA,RAPD)分子标记对以陆地棉中19为母本、海岛棉海7124为父本的F2作图群体和以中棉石系亚1号为母本、以草棉025562为父本的F5群体进行多态性分析,供试242个SSR标记中四倍体棉和二倍体棉两个群体中多态标记在分别为78个和43个,共有的多态标记有15个,连锁标记数分别为34个和19个,共有的连锁标记1个;ISSR多态标记在两个群体中分别为158个和43个,共有的多态性标记19个;RAPD多态标记在两个群体中分别为160个和61个,共有的多态性标记20个,连锁标记分别有45个和29个,共有的连锁标记有5个.构建了海陆群体的分子标记连锁图谱和中棉草棉群体的分子连锁图谱,四倍体连锁图包含34个SSR标记、24个ISSR标记和45个RAPD标记,平均图距为17.4cM,图距总长度为1791.1cM,覆盖棉花全基因组(5000cM)的37﹪;二倍体棉连锁图包含了19个SSR标记和29个RAPD标记,平均图距为13.6cM,图距总长650.6cM,覆盖二倍体棉花基因组的22﹪.比较两个图谱中的4对部分同源连锁群发现,四倍体棉和二倍体棉基因组序列部分同源,其中一个是倒位,发生在二倍体棉的A01与四倍体棉G20的连锁群上,其它几个属于序列部分同源区.进一步在分子水平上说明棉花异源四倍体形成过程中倒位及复制可能起了重要的作用.
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