随着产业价值链分解和专业化发展，物业管理出现精深精细化趋势，并从劳动密集型逐渐转化为知识密集型，在物业管理提升的基础上，产生了一个新型的领域——设施管理系统。设施管理系统的内容相当庞大且复杂，从设施建筑的规划，设计，建设，运营管理直到设施资产的处置，都属于该管理系统范畴。研究并找出一套适用于该复杂系统的理论方法是非常有必要的。首先本文在系统方法论的指导下，针对设施管理系统这个较复杂系统，从国内外现状分析了设施管理系统这门独特的学科，在研究设施管理系统定义和目标的前提下，提出了一个比较完善的系统方案评价指标体系。其次在建立了系统方案评价指标体系之后，分析和研究传统的系统评价方法以及传统方法在设施管理系统方案评价中的应用情况，然后在传统系统评价方法思想的指导下提出了基于逐对比较法和层次分析法的设施管理系统方案评价方法和评价模型。在本文的最后一章中结合企业实际案例背景，运用文中提出的系统方案评价模型和方法，对企业实际案例进行系统方案评价指标建立，评价权重和综合系统方案评价，最后通过具体数据验证评价方法的有效性和实用性。