【摘 要】
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为了获得具有组织表达特异性和与胁迫相关的小麦组蛋白H3,进一步了解组蛋白H3的功能。本文以拟南芥组蛋白H3的蛋白序列为信息探针,对小麦(Triticum aestivum)EST数据库进行同
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为了获得具有组织表达特异性和与胁迫相关的小麦组蛋白H3,进一步了解组蛋白H3的功能。本文以拟南芥组蛋白H3的蛋白序列为信息探针,对小麦(Triticum aestivum)EST数据库进行同源检索筛选,克隆了小麦组蛋白H3基因。通过生物信息学的方法对得到的小麦组蛋白H3基因进行分析,分析的内容包括:内含子形式,电子基因表达谱和电子染色体定位。并采用半定量RT-PCR的方法分析了小麦组蛋白H3基因在盐处理下的表达情况。研究结果如下:1小麦组蛋白H3基因的克隆以拟南芥组蛋白H3的蛋白序列为信息探针,BLAST检索GenBank中的小麦EST数据库,获得了小麦组蛋白H3基因的cDNA序列。为了进一步验证电子克隆序列的正确性,在起始密码子和终止密码子区域设计特异引物,经RT-PCR进行克隆、序列分析验证,最终得到7个小麦组蛋白H3基因且与电子克隆序列相一致。经过分析,这7个基因所编码的小麦组蛋白H3可以分为两类:H3.1型和H3.2型。2小麦组蛋白H3基因的生物信息学分析以普通小麦基因组DNA为模板,扩增上述7个基因基因组序列,获得了3个基因的基因组序列,有一个基因含有一个长度为198bp的内含子,该内含子较其它物种类似基因内含子长一些。采用UNIGENE数据库进行的组织表达谱分析表明,克隆的基因组织特异性表达不明显。采用GrainGenes数据库将这7个基因定位于7BL,4AL和7AS染色体上。3小麦组蛋白H3基因在盐胁迫下表达量分析采用半定量RT-PCR的方法,对所获小麦组蛋白H3基因在盐胁迫处理下的表达情况进行了分析,获得了一个随盐处理时间的延长表达量增高的组蛋白H3基因。
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