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采用PCR-SSCP技术对110只巴美肉羊进行CAST(第六外显子和3’非翻译区)和MyoD基因(第一外显子和5’侧翼区)SNP检测,并对其中26只12月龄母羊进行基因多态性与肉质性状的相关性分析,以期为两个基因作为羊肉质性状标记辅助选择分子可行性和巴美肉羊品系培育提供参考依据。本试验共筛选出六对具有多态位点的引物,分别为CAST-P1、CAST-P4、CAST-P5、CAST-P6、MyoD-T1和MyoD-T5。经遗传多态性分析,除CAST-P6为高度多态信息含量以外,其余五对引物均为中度多态信息含量。经测序分析,巴美肉羊CAST-P1产生三种基因型(AA、AB、AC)是由于56bp和184bp处碱基替换所致；CAST-P4产生三种基因型(AA、BB、BC)是由于117bp.131bp和201bp处碱基替换以及105bp处碱基缺失所致；CAST-P5产生两种基因型(AA、BC)是由于32bp处C-T碱基替换所致；CAST-P6产生三种基因型(AA、BB、BC)是由于135bp、142bp、148bp151bp处碱基替换所致。MyoD-T1产生两种基因型(AA、AB)是由于14bp处A碱基缺失和118bp处G-A碱基替换所致。基因型与肉质性状关联分析发现：巴美肉羊CAST-P1引物三种基因型在宰前活重、股二头肌处的红度值、臂三头肌处的pH1值存在显著性差异(p<0.05)；CAST-P4引物三种基因型在宰前活重、胴体重和背最长肌处的亮度值存在显著性差异(p<0.05);CAST-P5引物三种基因型(AA、BC、BD)在pH1值、色差值和背最长肌处的剪切力值存在显著性差异(p<0.05)；CAST-P6引物两个基因型(AA、BC)在背最长肌处的剪切力值、红度值和亮度值,冈上肌处的红度值存在显著性差异(p<0.05)；MyoD-T1引物从与AB基因型对巴美肉羊臂三头肌处的红度值和冈上肌处的亮度值影响达到极显著水平(P<0.01),两个基因型对臂三头肌和股二头肌处的pH1值和亮度值存在显著性影响(P<0.05)；MyoD-T5引物两个基因型对臂三头肌处的剪切力值、半腱肌处的黄度值和pH1值、冈上肌处的pH1存在显著性影响(P<0.05)。综上所述,两个基因与巴美肉羊肉质性状存在一定的关联性,可作为影响羊肉质性状候选基因进一步研究。