转运RNA衍生片段tRF-3019a在胃癌中的表达、临床意义及功能与机制研究

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目的:胃癌(Gastric cancer,GC)是全球范围内严重威胁人类健康的癌症之一,占全球癌症发生率的第三位,癌症相关死亡原因中位居第二位。尽管外科手术治疗和其它辅助治疗手段不断提高,胃癌的预后仍不满意。因此,探寻胃癌发生发展中复杂的分子机制,发现高效的胃癌早期诊断、预后评价的分子标志物和寻找靶向治疗的位点具有重要的临床意义。在生物体内转运RNA(transfer RNA,tRNA)是细胞蛋白质合成机器的一个重要元件,携带氨基酸进入核糖体内进行蛋白质的翻译。尽管已经进行了几十年深入细致的研究,但对于其功能的认识尚未完全明确,特别是其衍生的小分子RNA片段(tRNA-derived fragment,tRF)作为一种潜在的基因表达调控分子引起了研究者们的兴趣和关注,其功能正逐渐被人们所认识。越来越多的证据显示,来源于tRNA的小分子片段具有重要的生物学作用并引起国内外研究者的极大关注。但目前在胃癌中的生物学功能及机制仍不清楚。因此,我们探讨其在胃癌发生发展中的复杂的分子机制,为胃癌的治疗提供新思路和靶标。研究方法:第一部分,我们通过芯片数据分析差异表达的tRNA衍生片段,根据芯片结果,选择其中上调倍数最大的侯选指标tRF-3019a并进行验证。利用实时定量PCR(quantitative real‐time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测5种胃癌细胞系(AGS,HGC-27,MGC-803,MKN-45,SNU-16)和正常胃黏膜细胞系GES-1以及112对胃癌组织及配对癌旁非肿瘤性组织中tRF-3019a水平。同时,分析其表达水平与病人病理资料及预后信息,探寻其用于临床诊断的价值与意义。此外,我们利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)评价tRF-3019a的诊断效能,判断其在胃癌诊断中的敏感性和特异性。在第二部分,通过CCK8细胞增殖实验、细胞周期、细胞凋亡、Transwell细胞迁移、侵袭实验和划痕实验测定tRF-3019a对胃癌细胞增殖、细胞周期、凋亡、迁移和侵袭的作用。利用生物信息学和数据库预测tRF-3019a下游靶基因,结合GO功能富集和KEGG通路分析筛选下游靶基因。利用qRT-PCR、Western blot验证tRF-3019a的下游靶基因,利用荧光素酶报告基因验证tRF-3019a与下游靶基因是否存在直接结合关系。通过功能研究确定敲除下游靶基因FBXO47(F-box protein 47)对胃癌细胞功能的影响。通过实验验证tRF-3019a是否通过靶向FBXO47发挥生物学功能。结果:1、tRF-3019a在胃癌组织和细胞系中显著高表达,但与病人临床病理资料和生存时间无关。2、tRF-3019a在胃癌病人中ROC曲线的AUC为0.689(P<0.001)。3、过表达tRF-3019a促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭。4、抑制tRF-3019a能够减少胃癌细胞增殖、迁移和侵袭,但对细胞周期和凋亡无影响。5、确定FBXO47基因是tRF-3019a直接调控的下游靶基因。6、沉默FBXO47增强胃癌细胞增殖、迁移和侵袭。7、沉默FBXO47基因减弱tRF-3019a抑制剂对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用。结论:1、tRF-3019a在胃癌组织和细胞系中显著高表达。2、tRF-3019a对于胃癌及非癌组织具有一定的鉴别价值。3、tRF-3019a促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭。4、tRF-3019a通过靶向调控下游靶基因FBXO47,促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭。
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