水稻齿叶矮缩病毒（Rice ragged stunt virus,RRSV）引起的水稻齿叶矮缩病是南亚和东南亚稻区的重要病毒病,是呼肠孤病毒科水稻病毒属的典型代表。本研究通过有机试剂抽提,CF—11纤维素柱层析,从感病水稻组织中获取该病毒的全基因组双链RNA。根据泰国分离物（TH）对应片段的序列设计引物,通过RT-PCR技术成功地扩增到RRSV福建长汀分离物、沙县分离物和广东信宜分离物S₆-S₁₀全序列,并连接到pMD-18T载体上,转化大肠杆菌DH5α,质粒双酶切、质粒PCR和质粒PCR产物单酶切验证后经测序得到全长序列。对测序完成的RRSV福建长汀分离物、沙县分离物和广东信宜分离物S₆-S₁₀全序列进行同源性分析,并对变异位点进行统计。对这些片段测序所得的核苷酸序列初步分析表明,三个分离物S₁₀,S₇与TH-S₁₀,TH-S₇核酸同源性都为99%;S₆与TH-S₆核酸同源性为98%;CT-S₉和GD-S₉与TH-S₉核酸同源性都为99%,SX-S₉与泰TH-S₉核酸同源性为94%;CT-S₈和GD-S₈与TH-S₈核酸同源性都为99%,SX-S₈核苷酸序列与TH-S₈核酸同源性为93%。除SX-S₆,SX-S₇,SX-S₈及GD-S₇四个片段的某些碱基发生缺失,导致编码框移位而使得这些片段的开放阅读框（ORF）发生变化外,其它片段ORF与已报道的泰国分离物基因组对应片段的ORF大小相同。借助生物学软件及相关在线分析工具进行基于氨基酸序列的生物信息学分析,包括蛋白质理化特性、蛋白质功能域、基序（Motif）、二级结构等,分析表明P6蛋白具有核定位信号,分别位于377位（序列为PNSPKKR）、380位（序列为PKKREKA）;NS10蛋白、P9蛋白和P8蛋白各有一个R-2 motif;P9蛋白有一个螺旋卷曲区域,五个蛋白均无信号肽。