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林麝(Moschus berezovskii)是一种分布于中国西部和越南北部的高海拔动物。它历史上数量众多,但栖息地丧失和偷猎已经使得这一物种种群数剧烈下降,并因此而被IUCN列为濒危动物。本文主要研究结果为:1.描述了一个主要组织相容性复合体(MHC)基因座位的遗传多样性,并将促使这种多样性产生的动力因子区分开来。作者从四川的一个圈养林麝种群里发现了7个DRB第二外显子的等位基因。和其它濒危或者圈养有蹄类动物相比,圈养林麝的MHC遗传多样性水平较低。2.利用该圈养林麝种群的MHC等位基因进行分析,作者发现,非同义替换主要发生于推定的肽结合区域(PBR),进一步分析表明,重组和选择共同塑造了这一基因座位的遗传多样性。具体来讲,等位基因的重组产生了新的等位基因,正选择作用于PBR区域,而负选择(或净化选择)作用于非PBR区域。了解MHC功能基因的变异有利于优化林麝圈养繁育项目的规划和管理。3.本实验在之前研究的基础上进一步分析了来自四川西部和陕西秦岭两个区域圈养种群的林麝线粒体控制区和MHC DRB基因座位的空间遗传变异,揭示了这两个区域林麝的遗传结构和进化历史。4.本实验观测到两个区域圈养种群之间有中等水平的遗传分化,这种分化可能是由它们祖先的分化所导致的,分化时间可以追溯到大约37,800-56,700年前。MHC数据表明选择作用影响了这两个区域种群的DRB等位基因频率,这很可能反映了林麝对当地病原体的适应性。而且,秦岭种群的DBR等位基因和线粒体序列的遗传多样性水平要高于四川西部的种群,说明了四川西部的林麝历史上可能源于秦岭,种群数量历史的模型基本上支持这一点。5.基于两个区域圈养种群的遗传分化和地理分离,作者建议把这些区域作为不同的管理单元,从而维持这一物种的进化潜力。