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阿尔茨海默症是一种神经系统退行性疾病，目前临床上还没有能够治愈该病的有效药物。以microRNA（miRNA）为靶点的小分子药物是近年来提出的一种新型的用于治疗人类疾病的策略。本文使用一种系统的计算学方法在阿尔茨海默症中基于生物活性小分子扰动的基因表达模式和疾病相关miRNA调控的基因表达模式，构建了生物活性小分子-miRNA关联网络（bioactive Small molecule andmiRNA association Network in AD，SmiRN-AD），并对网络进行了拓扑学和功能学分析。本课题识别了496个显著的小分子-miRNA关系对（p≤0.01），其中包含了25个阿尔茨海默症相关miRNA和275个小分子。研究结果表明，与同一个miRNA连接的小分子药物倾向于共享药物靶点(Fisher精确检验，p=1.72×10-4)，倾向于属于相同的治疗学分类（Fisher精确检验，p=6.07×10-3）。此外，本课题对大规模预测得到的三对小分子-miRNA关联关系（正向关联关系对:quinostatin和miR-148b，amantadine和miR-15a;负向关联关系对:melatonin和miR-30e-5p）从生物学通路层面对小分子影响miRNA的作用模式进行剖析和推断。这些结果表明本课题提出的预测方法和分析策略为阿尔茨海默症的病理学和治疗学研究提供了新颖的思路，对小分子靶向miRNA这种新型药物作用方式的实验设计与研究具有一定的指导意义，有助于阿尔茨海默症治疗药物的研发，以及以miRNA为靶点的新型治疗策略的研究。最终，本课题还构建了一个较为全面的在线数据库SmiRN-AD(http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/SmiRN-AD/)，方便相关领域的科研人员查询阿尔茨海默症中潜在的小分子-miRNA关系对，展示miRNA靶基因在阿尔茨海默症中的差异表达模式。