本研究以高代自交纯合的商品成熟期果皮为绿色（246）和高代自交纯合的商品成熟期果皮为乳白色（247）的辣椒作为亲本,构建六个世代群体（P₁、P₂、F₁、B₁、B₂和F₂）,通过目测分级统计六世代遗传群体各单株在商品成熟期的颜色级值,运用色差仪分析测定六世代遗传群体各单株在商品成熟期果皮颜色L值、C值,采用六世代联合分析法对辣椒商品成熟期果皮颜色的遗传规律进行研究,与此同时,通过SSR分子标记技术对辣椒商品成熟期果皮白色基因进行初步定位。主要结果如下:1)辣椒商品成熟期果皮颜色的遗传方式为细胞核遗传,辣椒商品成熟期果皮绿色对乳白色的遗传规律符合2对主基因+加性-显性多基因模型（E-3模型）;L值、C值和颜色级值的F₂主基因遗传率分别为40.415%、90.524%和99.395%,其中颜色级值的F₂的主基因遗传力接近100%,多基因遗传力和环境效应较低,表明商品成熟期辣椒白色果皮的遗传选择可在早期进行世代分离。2)以商品成熟期果皮绿色（246）和果皮乳白色（247）高代自交纯合的辣椒为研究对象,对辣椒基因组418对引物对父母本进行筛选,筛选出11对有多态性的引物。以F₂分离群体作为研究对象,运用BSA法（分离群体分组分析法）建立白色和绿色基因池,在父母本间有多态性的11对引物对混合池进行筛选,总共筛出6对在两亲本、混合基因池之间均表现出多态性的SSR引物,分别是ES-65、ES-187、ES-273、ES-296、ES-357和ES-363。通过建立连锁图谱,确定6个标记位于两个连锁群上,其中ES-363、ES-273和ES-65位于一个连锁群上,遗传组距分别为5.58cM和5.08cM;ES-296、ES-357和ES-187位于同一个连锁群上,遗传组距分别为19.05cM和15.17cM。3)运用QTL IciMapping,通过采取CIM作图法对F₂群体的180个单株颜色性状进行QTL定位分析,发现了2个QTL位点,其中ES-357和ES-296之间有一个,LOD值为5.68,表型贡献率为7.57%,加性效应为1.14。ES-363和ES-273之间有一个QTL位点,LOD值为5.29,表型贡献率为10.15%,加性效应为1.39。本研究为后续的辣椒分子标记辅助育种和辣椒果皮白色性状的遗传奠定一定的基础。