现阶段,我国农村地区大量存在着以家庭为单位的农业生产经营者,但家庭式的农业生产经营方式越发不适应市场经济的要求,小农户处于市场交易的底端,自身利益难以保障。在城市资本流入农村市场、政府主导的社会化服务体系供给滞后,专业合作社发展面临困境的情况下,农户作为利益受损的一方急需一个综合性的服务组织,为他们降低生产风险,提供生活服务。为此,以农村社区为范围将农户组织起来的综合合作社应运而生。综合合作社是在家庭承包经营的基础上以合作的形式将农户组织起来,坚持自愿互利,对其成员提供农业技术培训、农业生产资料供应、农产品加工和销售、金融服务以及社区服务等。综合合作社以金融服务为核心将农产品生产、加工、销售环节有序地衔接起来,促进一二三产业在农村的融合发展,就地实现农民职业多样化,收入多元化,并在公共服务等事业上,带动农村朝向城乡统筹发展的道路。本文首先对综合合作社制度选择的理论基础进行阐述,从理论上论述在小农经济体系下,适合小农生产的合作制纵向一体化组织是嵌入社区的综合合作社。接着对综合合作社的发展现状以及存在的问题进行分析。然后通过对具有典型代表的综合合作社示范社运行机制以及日韩综合农协发展经验进行论述,从中得出政府积极扶持的,以农村社区为界限、以合作金融为支柱,逐步实现农业产业纵向一体化经营,提供社区服务的综合合作社是现阶段最符合我国情和最能保障农民利益的组织。最后对我国综合合作社存在的问题提出改进思路。本文认为要改进优化综合合作社的运行,最重要的是厘清政府与合作社的边界,政府在法律、税收、财政、金融以及公共服务平台等方面给以合作社外部支持,合作社在内部完善相应的治理结构,实现产业链条的纵向一体化延伸。本文的创新点在于研究的角度和内容,不足在于数据调研需要更加进一步深入和细致。