植物转录因子在植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的作用。bHLH转录因子是植物转录因子最大的家族之一。本研究以水稻日本晴为材料,以水稻基因组DNA为模板,通过特异PCR扩增,用回收纯化的PCR产物制作bHLH转录因子家族基因芯片;同时对五叶期幼苗进行20%PEG模拟干旱胁迫处理,于不同时间点取样提取RNA,与日本晴bHLH转录因子家族基因芯片杂交,结果分析表明:在PEG模拟干旱胁迫处理条件下,16个bHLH转录因子家族基因的表达至少在一个处理时间点呈现两倍以上变化,采用RT-PCR的方法对差异表达基因进行验证,结果表明验证芯片结果可靠。推测这16个转录因子基因可能与抗旱性或渗透胁迫抗性相关。同时,在苗期进行PEG模拟干旱胁迫和ABA处理,采用荧光定量PCR方法,比较分析本实验室水稻全基因组芯片结果中干旱胁迫差异表达的22个候选bHLH家族基因在PEG和ABA处理不同时间梯度的表达谱。结果表明大部分候选基因的PEG胁迫表达谱与干旱胁迫表达谱一致,验证了水稻全基因组芯片结果的可靠性;而在ABA处理下的大部分bHLH基因表现为抑制表达,部分基因的表达谱与干旱或PEG胁迫表达谱明显不同,推测这些bHLH基因参与PEG和ABA胁迫应答的具有相同或不同的分子路径或模式。在日本晴bHLH转录因子家族基因芯片和水稻全基因组芯片的结果里找到的可能与抗旱相关的基因中,有3个基因是共同的。这3个基因有较大的研究价值,本实验的研究结果对进一步克隆这些基因及分析其在植物生长发育过程中的分子调控模式打下了基础。