【摘 要】
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【研究背景】乳腺癌（breast cancer,BRCA）的发病率逐年上升,现已成为全球发病率最高的恶性肿瘤。据最新研究估计,2022年我国女性新发乳腺癌的病例数约为42.9万,死于乳腺癌的人数为12.4万,严重威胁着女性的健康。尽管手术、化疗、放疗和内分泌治疗是治疗乳腺癌的重要手段,但乳腺癌的发病率和死亡率仍处于高位。因此,迫切需要探索出新的乳腺癌诊断和预后相关的标志物及治疗靶点。RTN4IP1
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【研究背景】乳腺癌（breast cancer,BRCA）的发病率逐年上升,现已成为全球发病率最高的恶性肿瘤。据最新研究估计,2022年我国女性新发乳腺癌的病例数约为42.9万,死于乳腺癌的人数为12.4万,严重威胁着女性的健康。尽管手术、化疗、放疗和内分泌治疗是治疗乳腺癌的重要手段,但乳腺癌的发病率和死亡率仍处于高位。因此,迫切需要探索出新的乳腺癌诊断和预后相关的标志物及治疗靶点。RTN4IP1被认为是一种与网状蛋白4（RTN4）相互作用的线粒体蛋白。研究表明RTN4IP1表达异常与视神经萎缩、共济失调、智力迟钝、癫痫发作和恶性肿瘤密切相关。然而,关于RTN4IP1在乳腺癌中的研究鲜有报道。【研究目的】应用生物信息学的方法探讨RTN4IP1在泛癌及乳腺癌中的表达情况,并分析RTN4IP1的表达水平与乳腺癌患者临床病理特征的关系;探讨RTN4IP1在乳腺癌中的诊断及预后价值;探讨RTN4IP1在乳腺癌中的可能的生物学功能及分子机制;探讨RTN4IP1与免疫细胞浸润的关系。【研究方法】从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载BRCA数据及UCSC XENA数据库下载GTEx（正常样本）的RNA-seq数据,生物信息学分析RTN4IP1在乳腺癌和正常组织的表达水平;采用人类蛋白质图谱数据库（HPA）对RTN4IP1的蛋白表达水平进行验证;使用Wilcoxon秩和检验分析RTN4IP1的表达与乳腺癌临床病理特征的关系;Kaplan-Meier和Cox回归用于评估RTN4IP1与患者生存之间的关系;然后筛选出RTN4IP1高、低表达组的差异基因,并进行GO、KEGG和GSEA通路富集分析;利用STRING数据库构建RTN4IP1蛋白相互作用网络;此外通过ss GSEA分析RTN4IP1表达与免疫浸润之间的相关性。【研究结果】生物信息学分析显示RTN4IP1在多种肿瘤组织中表达异常。RTN4IP1m RNA及蛋白在乳腺癌组织中表达水平明显高于正常乳腺组织。RTN4IP1表达与T分期、N分期、病理分期、ER状态、PR状态、HER-2状态、PAM50、绝经情况、种和组织学类型有关（P＜0.05）。Kaplan-Meier生存分析显示RTN4IP1高表达患者具有较差的OS（HR=1.81,P＜0.001]）、DSS（HR=2.27,P＜0.001）和PFI（HR=1.52;P=0.012）。ROC曲线分析显示,RTN4IP1具有较强的诊断价值（AUC=0.784）。单变量Cox回归分析显示RTN4IP1的高表达与较差的OS之间存在相关性（HR=1.810,P＜0.001）。多变量Cox回归分析显示年龄（HR=2.266,P＜0.001）、ER状态（HR=0.527,P=0.002）、病理分期（HR=2.159,P=0.009）和RTN4IP1表达（HR=1.557,P=0.029）是影响乳腺癌患者OS的独立因素。GSEA分析表明RTN4IP1主要富集在体液免疫应答、先天性免疫应答、小核糖核蛋白质复合物、剪接体复合物的组装和sm样蛋白家族复合物通路中。PPI网络中包含了共同调节蛋白。ss GSEA分析显示RTN4IP1的表达与多种免疫细胞浸润相关。【结论】生物信息学分析表明RTN4IP1在乳腺癌中表达明显上调,RTN4IP1高表达提示预后不良。RTN4IP1可能通过调控免疫细胞浸润促进乳腺癌的发生和发展,RTN4IP1有望成为乳腺癌不良预后的生物标志物和潜在的治疗靶点。
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