2010年4月-12月对南四湖大型底栖动物的群落结构进行了季度调查，分析了南四湖大型底栖动物的物种数、现存量、优势种、功能摄食类群及其时空变化，探讨了南四湖大型底栖动物群落的演替规律及影响因素，并根据大型底栖动物群落结构对南四湖水质进行了生物学评价，为南四湖水生生物资源保护和监测调水工程对南四湖生态系统的影响提供背景资料。主要结果如下：1、南四湖共计有大型底栖动物35属40种，其中寡毛类4属6种，软体动物10属10种，水生昆虫15属17种，其它6属6种。四个子湖泊中微山湖物种数最多，南阳湖最少；综合四季来看，冬季物种数最多，夏季最少。2、南四湖大型底栖动物全湖的年平均密度为1103ind/m~2，年平均生物量为82.09g/m~2。全湖寡毛类的年平均现存量为232ind/m~2和0.48g/m~2；软体动物的年平均现存量为71ind/m~2和74.02g/m~2；水生昆虫的年平均现存量为884ind/m~2和6.59g/m~2。寡毛类和软体动物的现存量以独山湖最高，水生昆虫是以南阳湖最高。除微山湖外，其它三个湖区中水生昆虫为绝对密度优势群，其密度均占各湖区底栖动物密度一半以上；软体动物是四个湖区的绝对生物量优势群，占底栖动物总生物量的90%以上。3、南四湖四季大型底栖动物密度冬季最高，生物量则是秋季居首；现存量最低的是夏季。寡毛类密度冬季最高，达到397ind/m~2，现存量夏季最低；软体动物密度夏季最高，为120ind/m~2，而生物量秋季最高，为123.82g/m~2；水生昆虫现存量冬季最高，夏季最低，两者相差近四十倍。4、南四湖大型底栖动物的优势种为红裸须、霍普水丝蚓、长角涵螺和铜锈环棱螺，用Morisita指数测定其优势种均呈现核心分布。南四湖各子湖泊大型底栖动物优势种均有区别，南阳湖优势种最少，只有红裸须和铜锈环棱螺；独山湖的优势种比南阳湖多出一种霍普水丝蚓；优势种最多的微山湖和昭阳湖分别比独山湖多出一种，分别为长角涵螺和背角无齿蚌。霍普水丝蚓和铜锈环棱螺是南四湖四季均出现的优势种，冬季拥有绝对优势的红裸须在夏季不呈现优势。5、南四湖全湖的大型底栖动物功能摄食类群的平均密度以直接收集者为最高，为1022ind/m~2，占总数的87.6%，而从平均生物量来看，刮食者为54.39g/m~2，占总数的65.9%，其次为过滤收集者，为21.08g/m~2，占总数的25.5%。不同季节中，南四湖大型底栖动物密度仍是以直接收集者为主要类群，生物量方面，微山湖和昭阳湖以过滤收集者最多，其它两湖以刮食者占优。6、结合K-优势度曲线，南四湖大型底栖动物多样性微山湖＞独山湖＞昭阳湖＞南阳湖；南四湖大型底栖动物多样性冬季最低，夏秋季较高。7、南四湖四个湖区大型底栖动物在不同季节里群落物种组成差别较大，群落构成并不相似；对比以往资料，南四湖大型底栖动物群落物种数减少，现存量下降，耐污种增加。8、根据Shannon-Weaver多样性指数(H’)、Pielou均匀度指数(J)、Margalef丰富度指数(dM)和Simpson优势度指数(D)评价了南四湖水质。结果显示，南四湖水质整体上处于轻-中度污染状况。四个子湖区受污染程度依次为南阳湖＞昭阳湖＞独山湖＞微山湖，最南面的微山湖湖区总体明显好于最北面的南阳湖，因为南阳湖临近济宁，受工业化影响显著；南四湖四季除冬季外，其它三季均呈现中度污染状态，而南四湖冬季水体评价多样性指数最低，可能是由于红裸须冬季大量繁殖的原因，与水质好坏无关。