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龙虾类(Palinura)属甲壳纲(Crustacea)十足目(Ddcapoda)爬行亚纲(Reptantia)。形体较大、肉质细嫩，滋味鲜美且外形五彩缤纷，因此具有较高的经济价值和观赏价值，是我国福建，台湾和广东近海重要的渔业资源。本文以总DNA为模板采用步移PCR扩增法测定了波纹龙虾和杂色龙虾的线粒体基因组全序列。并探讨了龙虾类mtDNA分子进化的特点，结果表明： 波纹龙虾和杂色龙虾mtDNA全序列长度分别为15665 bp和15700 bp，在GeneBank登录号分别为JN542716和JQ320274。波纹龙虾和杂色龙虾线粒体基因组全序列的排列顺序及组与其他一些物种线粒体相似：由13个蛋白质编码基因(pxotein-coding genes，PCGs)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16sRNA和12sRNA)和一段A+T富集区组成。其中有14个基因位于轻链(L)上，分别为12sRNA，16sRNA，nad1，nad4L，nad4，nad5，tRNAVal，tRNALeu-CUN，tRNAPro，tRNAHis，tRNAPhe，tRNACys，tRNATyr，tRNAGln其余23个基因位于重链(H)上。 两种龙虾的atp6与atp8之间和nad4与nad4L之间的重叠情况一致，均重叠7个碱基。除cox1和nad2，其余的11个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子，在其他物种的线粒体全序列中的起始密码子使用情况与之相似。had2以GTG为起始密码子，cox1的起始密码子是ACG，这在后生动物中也曾见报道。除atp6、atp8、cox3、nad1、nad2、nad4L和nad6的终止密码子是TAA外，其余的终止密码子为不完全的T或TA，其转录产物的3’末端为U或UA，可在转录后加工过程中加接多聚腺苷酸尾巴，从而形成完整的UAA终止密码子。控制区是AT富集区，也是整个mtDNA中变异最大的区域。22个tRNA中，除了tRNASer(AGY)基因的二级结构缺少DHU臂外，其余都为典型的三叶草结构，tRNA折叠除正常的碱基配对之外，还存在碱基U和G的错配现象。 本研究利用线粒体全序列、Cytb、cox1和16SrRNA建树来阐明龙虾类的系统发育，为进一步对龙虾类分子生物学的研究奠定基础。