番鸭异常行为及相关基因差异性表达研究

来源 :贵州大学 | 被引量 : 8次 | 上传用户:cnforyou2009
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为深入研究番鸭异常行为,更好的服务于畜禽生产与动物福利,本实验从行为学和遗传学角度,对番鸭异常行为方面数据及相关数据进行分析。通过Media Record软件对番鸭行为进行跟踪记录,并运用Observer XT软件对番鸭行为进行定义,制定番鸭行为谱,行为谱包括运动与休息行为组、修饰行为组、警戒与攻击行为组、异常行为组和其他行为组。以60只番鸭为实验动物样本,运用DNA池-PCR扩增后直接测序的方法筛选NR3C2和CRHBP基因SNP位点,并进行生物信息学分析。通过行为学软件将番鸭根据行为不同分成4个组,采取脑、肝、肾、胸、腿和胆共6个番鸭组织进行差异性表达研究。对已筛选出的SNP位点进行单个体测序,并于对应异常行为和攻击行为进行相关性分析。  本研究主要内容包括:⑴行为学数据分析结果显示:啄肛番鸭组、被啄肛番鸭组、较强攻击倾向番鸭组和正常番鸭组除警戒与攻击行为组出现明显不同外,其他行为组也存在明显差异。对番鸭各行为间进行关联性分析,大多数行为间呈显著相关或极显著相关。⑵多态位点筛选及生物信息学分析结果显示:NR3C2基因共找到7个SNP位点,分别是:Intron2-G13928T, Intron2-A13972G, Intron2-T14336C, Intron4-A34930G, Intron4-T35157G, Exon8-G198088A和 Exon9-G199134C;CRHBP基因共找到12个 SNP位点,分别是:Exon3-G5805A、Exon3-C5906T、Exon7-A10747G、 Intron3-A5984G、 Intron3-T6019G、 Intron3-C6021T、Intron3-G6035A、Intron3-G6036A、Intron7-C10506T、Intron7-A10613G、Intron8-G12097A和Intron8-G12118A。NR3C2基因突变前后等位基因频率估算、mRNA二级结构预测和蛋白质二级结构预测均出现明显差异,蛋白质三级结构预测无明显差异。CRHBP基因突变前后等位基因频率估算和 mRNA二级结构预测均出现明显差异,蛋白质二级结构预测和蛋白质三级结构预测无明显差异。⑶差异性表达研究结果显示:在四组番鸭中,NR3C2基因在脑、肝和肾组织中表达水平差异不大;在胆组织中,NR3C2基因在不同番鸭个体中存在明显变化,其表达水平最高的是正常番鸭,其次为被啄肛番鸭,再次是较强攻击倾向番鸭,表达水平最低是啄肛番鸭。在四组番鸭中,CRHBP基因在肝、肾、胸、腿和胆组织中表达水平差异不大,且表达水平极低;在胆组织中,CRHBP基因在不同番鸭个体中存在明显变化,其表达水平最高的是正常番鸭,其次为被啄肛番鸭,再次是较强攻击倾向番鸭,表达水平最低是啄肛番鸭。⑷攻击行为与异常行为相关性分析结果显示:NR3C2基因的G199134C位点与番鸭的行为性状指标差异均不显著。CRHBP基因的A10747G位点GG型与番鸭的攻击行为性状指标呈显著相关,可能与番鸭攻击行为有关,G5805A和 C5906T位点与番鸭行为性状均无显著差异。
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