糯性水稻分子标记的建立和分子标记辅助育种检测方法的相关研究

来源 :中国科学院成都生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sun_sun
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糯性水稻是水稻的一种类型,在亚洲,特别是中国有着悠久的种植历史和食用传统.目前对糯稻品种的选育一般还停留在传统的选育水平,有关糯稻分子标记辅助育种的研究还未见报道.该文根据已测知的非糯水稻蜡质基因全序列,设计了9对PCR引物,扩增粳糯和灿糯蜡质基因远端调控区、启动子和编码基因全序列.与非糯蜡质基因相比,发现在两种糥性蜡质基因第二外显子上都有一段23bp的重复序列插入并生成一个无义终止密码子.为了使分子标记辅助育种发挥更大的优势,该文还对分子标记检测方法进行了相关研究.建立了两种不同的快速制备水稻总DNA简单方法,其中TritonX-100法提取的DNA具有很好的完整性,可用于后续其他分子生物学操作;NaOH法提取的DNA虽然降解严重,但是及时用于PCR及相关分析同样可行.两种方法均可在短时间内处理大批量的样品,操作简单,效果可靠,适于进行遗传连锁分析和分子标记辅助选育时的单株检测.此外,该文还研究了水稻SSR标记电泳检测中杂合体特殊条带的成因.经实验验证特殊条带是由杂合体在PCR过程中产生异源dsDNA所致.以此特殊条带为标志,在聚丙烯酰胺凝胶上仅经短时间电泳,即可快速准确地识别出杂合体.该论文建立了糯稻的DNA标记,不仅为糯稻的选育提供了强有力的工具,而且为深入研究水稻蜡质基因提供参考.在相关分子标记检测方法的研究方面,该论文创立了快速制备水稻总DNA的简单方法,大大缩短了大批量样品检测的时间,使分子选育和遗传分析更为简便.同时还研究了SSR分析中特殊条带的成因,既为解释这一特殊现象提供佐证,也使杂合体的选育更加准确快捷.结合运用该论文这两方面的研究成果,相信会在水稻育种中发挥重要的作用.
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