TALEN介导的家蚕基因组编辑研究

来源 :西南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:robert610
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因组编辑是建立在基因靶向修饰的基础上,对生物基因组进行改造的一项新技术,通过在基因组水平上进行精确的基因编辑,实现基因的敲除、敲入、结构变异。凭借基因编辑工具,人们可以更加准确、深入地了解探究基因功能、研究疾病机理、建立新品种,寻找到遗传性疾病治疗有效的手段。因此在研究和临床应用具有极其广泛的发展前景和应用价值。   家蚕(Bombyxmori)既是蚕丝产业的重要基础,又是鳞翅目昆虫研究的典型模式生物,同时也是开发新一代生物反应器和新型昆虫产业的材料。家蚕是最早完成全基因组测序的鳞翅目昆虫,它的遗传背景清楚、基础研究积累丰富,随着基因组研究、特别是功能基因组研究工作的深入,家蚕的后基因组时代的研究已经有了良好的基础。在全基因组序列测定的基础上,从整体水平研究基因及其产物在不同时间、空间、条件下的结构与功能的关系,将极大地推动整个昆虫学科和蚕业的发展。   TALENs是基于植物病原体黄单胞菌分泌的一种转录激活子样效应因子而设计和构建。将TALE蛋白中的DNA结合域与FokⅠ核酸内切酶的切割域融合,在特定位点产生双链断裂,利用细胞自身的DNA修复机制(非同源末端连接NHEJ或同源重组修复HR)引入基因突变,基因修饰或基因敲入,从而实现基因组的定向编辑。   本研究针对家蚕BmBlos2和Bm702基因,设计了靶向TALENs,成功构建了数对TALEN打靶载体,结合ssODN技术,在体外合成mRNA,以P50和Nistari两个品系为对象,通过胚胎显微注射该mRNA,来探索TALEN技术在家蚕基因编辑中的应用。主要结果如下:   1、TALEN打靶载体的构建   依赖于标准的限制性内切酶和连接的克隆手段等,我们尝试了根据家蚕密码子和预测TALEN的打靶位点的氨基酸序列直接合成DNA片段,再加到含有FOK(Ⅰ)的骨架载体上的方法,针对家蚕BmBlos2第二和第三外显子、Bm702基因分别构建了B2-TALEN、B3-TALEN、702-TALEN表达载体,并制备了相应的mRNA。   2、TALEN介导的家蚕基因BmBlos2的敲除   在体外合成B3-TALENmRNA表达载体,以700ng/ul分别注射家蚕Nistari品种的早期胚胎,在G0代五龄幼虫时期,观察到了透明的油状皮肤表型,将突变个体提取基因组并进行了测序分析,观察到缺失、插入突变、单碱基突变等多种突变类型,证明TALEN能在家蚕中不仅能介导高效率的定点突变,而且能产生可遗传的突变表型。   3、TALEN介导的长片段基因组删除   将B2-TALEN和B3-TALENmRNA表达载体,同时混合以350ng/ul的浓度注射家蚕Nistari品种的早期胚胎,我们两个具有突变表型的品系各随即选择了7头蚕,对其进行基因组提取、PCR扩增和测序,结果表明TALEN通过两个DSB能够介导两个位点间的大片段删除,而且这种删除是可以遗传的。   4、TALEN介导的家蚕基因组结构变异   通过荧光素酶SSA分析和T7核酸内切酶活性分析来检测702-TALEN活性:通过荧光素酶SSA实验,用thepSSA-Lucvector转染人类胚胎肾(HEK)293T细胞系,结果显示活性提高了28倍,证明702-TALEN在HEK293T具有很高的活性来提高同源重组概率;通过T7EI检测实验,扩增出的PCR产物被酶切为两个片段,证明702-TALEN能够在内源性基因座位上通过NHEJ修复途径诱导有效的突变。   我们在体外将转录B2-TALENmRNA和702-TALENmRNA,混合并同时注射了大约100个蚕卵。注射三天后,提取胚胎基因组,通过PCR,用检测大片段删除、重复和翻转的引物组合均能扩增出于预期大小一致的目的条带,证明TALEN可以在家蚕中诱导基因组结构变异。   5、TALEN和ssODN介导的长片段基因组删除   将合成的ssODN和B2-TALENmRNA共同进行胚胎微注射,将具有嵌合体表型与其余的没有嵌合体表型的G0代蚕蛾进行提取基因组和进行PCR扩增,结果显示在具有嵌合体表型的个体中能扩增出与预期一致的目的条带。在父本是嵌合体的G1代蛾圈中,发现了5头有透明状皮肤表型的家蚕,证明ssODN介导染色体上的片段缺失是可以遗传的,对其基因组进行PCR和测序分析发现,G1代个体中存在长片段删除以外的未知的变异。
其他文献
  有机镁试剂(格氏试剂)是人们最早认识并广泛使用的金属有机试剂之一,但是关于有机镁,尤其是烯基镁的结构报道却不多见,烯基镁的表征仍然是一个挑战。为此,我们尝试得到烯
会议
  发展新的方法学高效地获得手性配体骨架,以及发展结构新颖、高效和高选择性的手性配体,是不对称催化的重要任务之一。我们小组采用铱催化的不对称氢化-缩酮化策略,首次实
会议
新的一年开始了。我们面对的2014这个新年,既是改革之年、突破之年,也是发展之年、希望之年。一次次盛会,绘就了改革创新的蓝图,一项项举措,展现了美好生活的愿景,我们走在改
  P-手性膦配体在不对称催化发展过程中有过重要的历史作用。然而,由于这类配体合成难度较大,新型P-手性膦配体及其在不对称催化反应中的应用发展缓慢。我们课题组致力于新
会议
  惰性C-H键的官能化研究成为有机化学研究热点之一,由于其独特的魅力和挑战性,被誉为“化学的圣杯”。我们小组主要致力于发展后过渡金属Au、Re,以及采用光氧化还原催化实
  Carbenoid chemistry has become a powerful tool in organic synthesis,diazo compounds are commonly used important precursors of metal carbene,and they have at
会议
脊髓灰质炎是一个古老的人类疾病,它由脊髓灰质炎病毒引起。这种疾病在19世纪末突然开始流行,在20世纪中期成为全球最恐怖的疾病之一,对于疾病突然流行的原因目前并不清楚。本研
  金属卡宾是一类非常重要的有机合成中间体。我们一直致力于探索金属卡宾新的转化过程,并由此发展新的方法学[1]。近年来的研究发现,金属卡宾能发生转移插入过程,其与交叉偶
会议
近年来,抗生素所造成的环境问题越来越受到人们的关注,细菌会在抗生素作用下产生耐药性,而且会发生选择性进化,所以人和动物体内一些本来很容易用常用抗菌药物治愈的细菌性感染会
  On the behalf of green and sustainable chemistry,molecular oxygen is an ideal oxidant and offers attractive academic and industrial prospects.1 Recently,we
会议