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目的:开发与广西莪术优良种质资源优势相关的新型EST-SSR分子，能够在广西莪术种质检测到DNA多态性;优选广西莪术优良种质资源，分析广西莪术种质资源的遗传多样性，促进广西莪术分子育种应用，提高分子育种优势。 方法:采用改良CTAB法提取广西莪术基因组DNA，正交试验法建立和优化SSR-PCR反应体系反应程序;下载Genbank/dbEST数据库中公布的所有姜黄属EST序列，对这些序列进行前期处理，利用在线SSRfinder进行SSR位点搜索，搜索结果进行SSR信息分析;采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物;上海生工合成引物，选用6个广西莪术品种进行有效性检测。 结果:得到一种适用于广西莪术SSR分析的DNA提取方法，建立和优化SSR-PCR反应体系和反应程序;下载得到的12678条EST序列中，发现935条序列含有SSR位点，占整个EST数据库的7.37％，其中含有一个SSR位点有712条序列，其次是含有两个SSR位点的序列163条;SSR位点总计1243个，其中含有二核苷酸重复序列的SSR位点最多、其次是三核苷酸和四核苷酸，分别为626(50.36％)个、392(31.54％)个和128(10.30％)。二核苷酸重复中，以AT/TA和CT/GA出现频率最高、分别占SSR总数的13.84％和4.42％，其次是GA/CT(4.10％)和CA/GT(1.69％);三核苷酸重复中， CCG/GGC(2.01％)、CTT/GAA(1.61％)、CGG/GCC(1.61％)、AAT/TTA(1.37％)、TTC/AAG(1.13％)、CCA/GGT(1.13％)以较高的频率出现;四核苷酸重复中，TATA/ATAT出现频率最高，所占比例为(1.53％)，其次为GAGA/CTCT(1.21％)，CTCT/GAGA(1.13％);六核苷酸中，TATATA所占比例较高，为0.965％。根据筛选得到的微卫星序列共设计了325个EST-SSR引物对，选择其中90分以上的126个合成。PCR检测表明，104个引物对(82.54％)可以扩增出稳定清晰的带型;在6份不同种质广西莪术中检测到48个EST-SSR引物有多态性，占设计引物的38.09％。 结论:采用改良CTAB法提取得到符合试验要求的基因组DNA;采用正交试验法，得到适用于广西莪术的SSR-PCR反应的体系和反应程序;对姜黄属EST-SSR进行信息分析，设计并合成EST-SSR标记共126对，104对引物可以扩增出条带，其中48对引物具有多态性，多态性比率为38.09％。这些EST-SSRs将有助于广西莪术基因组学方面的研究。