猪十种常见疫病病毒多重PCR和基因芯片检测方法的研究

来源 :青岛农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qianchen912009
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猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)、猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)、猪圆环病毒2型(Porcine circovirus2, PCV2)、猪细小病毒(Porcine parvovirus, PPV)、猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(porcine trans-miscible gastroenteritis of swine, TGEV)、猪流感病毒(Swine influenza virus, SIV)、猪巨细胞病毒(Porcine cytomegalovirus, PCMV)和口蹄疫病毒(Food-and-mouth disease virus, FMDV)是猪养殖业中常见的十种疫病病原。近年来,猪疫病日益呈现复杂化和严重化的发展趋势,多种病毒混合感染的比重增加,这一现状增大了临床诊断和实验室诊断的难度。因此建立这十种病毒的快速检测技术,来加强对这些病毒引起的猪疫病的流行动态及分布研究,以及减少养猪业经济损失,促进其健康发展,具有极为重要的意义。  本研究主要内容包括:⑴根据GenBank中已发表的CSFV毒株、PRRSV美洲型毒株、TGEV毒株、PEDV毒株、PRV毒株、PCV-2毒株、FMDV毒株、SIV、H1N1、H3N2毒株、PPV毒株和PCMV病毒株基因序列,对各病毒基因区进行同源性分析,选择保守区域设计合成10对特异性引物,然后进行单基因PCR反应验证其特异性,在此基础上建立和优化了10种病原的两个多重PCR检测体系,其最低检测限度可达104 copies/μL。分别用多重PCR和普通PCR、RT-PCR检测145份临床病料,符合率为97.93%,结果表明该检测技术适用于临床病料的检测及快速诊断,具有较大的实际意义和应用价值。⑵通过序列分析、靶标与探针杂交试验、杂交条件优化试验建立了猪十种常见疫病病毒基因芯片的检测方法,根据CSFV、美洲型PRRSV、TGEV、PEDV、A型SIV、PRV、PPV、PCV-2、PCMV和FMDV核酸的保守区域,设计10对特异性引物,将扩增纯化后的靶基因点制成芯片,通过Cy3标记的特异性引物扩增病毒核酸制备探针,再与芯片杂交,扫描分析结果。通过对芯片杂交条件的优化,发现在点样靶基因浓度400μg/mL、杂交条件为55℃时与探针杂交2h的情况下,可获得理想的杂交结果。试验结果表明芯片检测十种病毒特异性好、灵敏度高,最低检测限度可达105 copies/μL,应用基因芯片技术和普通PCR/RT-PCR、多重PCR检测临床病料32份,芯片检测与普通PCR的符合率为93.75%,与多重PCR的符合率为90.63%。初步研究表明,应用DNA芯片技术可同时同步检测多种猪疫病病毒,且该方法为临床病料的初步诊断提供了一个新的、可靠性方法。⑶将基因芯片检测技术应用于动物疫病的检测,成功构建了猪常见10种疫病病毒的多重PCR检测技术和基因芯片检测技术平台,为今后利用基因芯片技术进行动物病毒病诊断和研究提供理论依据,也为控制和消灭疫情奠定了基础,具有重大的理论意义和应用价值。
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