RNA干扰(RNA interference, RNAi)是由双链小干扰RNA (small interfering RNA, siRNA)诱导的转录后基因沉默现象,能够使靶标mRNA降解或抑制其翻译,是生物界古老且进化高度保守的现象之一。本文旨在以内源性siRNA介导的RNAi为基础,运用生物信息学的原理和方法,在若干种生物的基因组中寻找进化保守的基因相互作用网络。我们获取了多个物种的基因组序列的数据,分别预测了每个物种基因组内含子中的siRNA及其靶标基因,再分别统计这些siRNA源基因及其靶标基因在分子功能、细胞成分和参与的生物过程中的分布情况。通过对统计结果的比较,发现内源性siRNA在分子功能方面以酶活性的显著性最高,在细胞成分方面以细胞组分显著性最高,而生物过程方面则参与调节多个生理过程。这说明,siRNA源基因及其靶标基因在生物个体的各个生命阶段都发挥着重要作用,也就是在生物个体发育之初,siRNA就开始发挥调控作用。根据这个结论,我们预测在生物个体中存在一个由siRNA介导的进化保守的基因相互作用网络。因此,以线虫为研究对象进行验证。