本研究以采自河南省不同地区的15个居群的野生狗牙根(Cynodon dactylon(L.)Pers.)为研究材料,采用表型性状和SSR分子标记相结合的方法对供试狗牙根居群的遗传多样性进行分析,本研究结果可以为河南省野生狗牙根种质资源的开发利用提供理论参考。研究结果如下:(1)基于表型性状的狗牙根居群遗传多样性分析结果表明,各供试性状的变异系数从大到小依次为草层高度>匍匐茎叶长>匍匐茎节间长>直立茎叶长>匍匐茎叶宽>直立茎叶宽>节间直径,平均变异系数为32.85%。15个居群的表型性状的平均变异系数不同,其中P11(淅川)居群的平均变异系数最大(30.57%),P2(濮阳)居群平均变异系数最小(23.38%);匍匐茎节间长度和草层高度在15个居群间存在极显著差异,匍匐茎叶长和直立茎叶长存在显著差异,匍匐茎叶长、直立茎叶长和草层高度在居群内存在极显著差异,匍匐茎节间长度在居群内存在显著差异,匍匐茎和直立茎的叶宽、匍匐茎节间直径在居群间和居群内均无显著差异或极显著差异;居群内的方差分量大于居群间的方差分量,表明居群内变异是表型遗传变异的主要来源;6对表型性状存在极显著相关,4对性状存在显著相关;直立茎叶宽与年降水量呈极显著负相关;匍匐茎叶宽与年降水量呈显著负相关;匍匐茎叶宽和直立茎叶宽与纬度呈显著正相关;对15个狗牙根居群进行聚类分析,在相似性系数0.028处将15个居群分为4组,结果表明地理位置上相近的居群并没有完全聚在一起,对居群间的地理距离与遗传距离进行Mantel检验,结果表明二者之间相关性不显著。基于表型性状的居群间遗传距离矩阵与纬度矩阵呈极显著正相关,与年降水量矩阵呈显著负相关,遗传距离与其他环境因子间无相关性。(2)基于SSR标记的狗牙根居群遗传多样性分析结果表明,供试的288份材料共扩增出162条带,平均每对引物扩增条带数为16.2,多态性条带为155,多态性比例为95.68%;平均观测等位基因数(Na)为1.5061,平均有效等位基因数(Ne)为1.3183,平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.1688,平均Shannon’s遗传多样性信息指数(I)为0.2775;遗传分化系数和基因流分析结果表明,15个狗牙根居群存在较大的遗传分化,遗传变异主要存在于居群内,与表型遗传变异分析结果一致。15个居群的平均遗传一致度是0.767,平均遗传距离为0.270,在遗传一致度0.71处,可将15个居群的狗牙根分为两个类群。Mantel检验结果表明居群间的地理距离与遗传距离之间不存在显著相关性。