生态功能区划,是指在分析研究区域生态环境特征与生态环境问题、生态环境敏感性和生态服务功能空间分异规律的基础上,根据生态环境特征、生态环境敏感性和生态服务功能的重要程度在不同地域的差异性和相似性,将区域空间划分为不同生态功能区的研究过程。其目的是为制定区域生态环境保护与建设规划、资源合理利用与工农业生产布局、区域生态环境保护提供科学依据,并为环境管理部门和决策部门提供管理信息与管理手段。生态系统区域分异规律、生态系统等级理论以及景观生态学理论是进行生态功能区划的理论基础。进行生态功能区划应遵循的一般原则包括生态环境为基础、社会经济为主导、协调平衡发展原则,主导性原则,相似性原则,区域共扼性原则和方便管理的原则。　　本文根据敦煌地区目前主要的生态问题:保护区西北部区域水生态环境失衡、水资源和湿地逐渐萎缩、生物多样性降低、草场植被退化较严重、土地沙化不断扩大和蔓延、自然灾害加剧、文物保护和自然景观的存续受到严重威胁、生态承载力低下、生态环境十分脆弱、现状水资源量超载,最终确定以生态敏感性、生态服务功能和生态承载力作为区划的评估因子。　　评价结果显示敦煌生态功能保护区主导生态功能确定为防风固沙和水源涵养,辅助生态功能确定为水资源和生物多样性保护功能;土地沙漠化敏感程度极高;土地盐渍化高度敏感;生物多样性及生境敏感性高;冰川、湿地生态系统水源涵养功能属于极重要级别。在此基础上针对敦煌地区生态环境地域分异规律,确定区划的原则、分区依据和指标,将敦煌生态功能保护区划分为十一个功能区,并根据各功能区的生态环境特点、主要生态环境问题和主导生态功能,提出生态保护与建设的重点任务和具体措施。