纤毛虫是一类广泛分布于海洋、淡水和土壤生态系统的单细胞真核生物,具有较高的多样性。纤毛虫粒径通常在5-200微米之间,是海洋浮游生物的重要组成部分。纤毛虫可摄食微型和微微型浮游生物,如细菌、鞭毛虫、浮游植物等,其自身又可作为中型浮游动物如桡足类及鱼类幼体的食物来源。因此,纤毛虫是连接微食物环与经典食物链的纽带,在海洋生态系统的物质循环和能量流动中发挥着重要作用。基于高通量测序技术进行纤毛虫生态学研究时,由于测序长度限制,多采用小亚基核糖体基因可变区来揭示群落的组成。由于引物的偏好性,基于不同引物所反映的群落结构与多样性可能不同,然而针对纤毛虫群落,目前尚未有研究对此差异进行阐述,在一定程度上限制了基于不同引物对所开展相关工作间的比较。纬度多样性梯度是宏观生态学和生物地理学中最显著的模式之一。针对纤毛虫类群,相关工作主要集中于砂壳类纤毛虫,而针对纤毛虫全类群的研究较少。已有研究表明,粒径是区分微型浮游生物的重要特征,即不同粒径微型浮游生物具有显著不同的群落组成。然而,对大空间尺度跨度下,不同粒级纤毛虫空间分布的研究十分缺乏;微生物群落由少数高丰度类群（即丰富亚类群）和多数低丰度类群（即稀有亚类群）构成,研究丰富和稀有微生物的多样性和空间格局具有重要生态学意义,但目前研究多聚焦于细菌与微微型浮游植物,针对纤毛虫群落的相关研究十分有限,亟需进一步的探索。基于以上研究空白,本论文开展如下工作:（1）利用高通量测序技术,基于使用频率较高的两对纤毛虫特异性引物,即Cil-F/Cil-R与384F/1147R,从群落组成、多样性与空间分布模式等方面对西北冰洋不同生境（海水区、过渡区和融池区）的纤毛虫进行研究,结果表明:ⅰ)基于不同引物所揭示的纤毛虫群落组成和多样性具有显著差异。在组成方面,两对引物都表明旋毛纲、侧口纲和叶咽纲是北冰洋区域的优势类群,但与Cil-F/Cil-R相比,384F/1147R群落中旋毛纲和叶咽纲的比例有所下降,侧口纲的比例增加。在多样性方面,Cil-F/Cil-R的多样性显著高于384F/1147R;ⅱ)基于不同引物所揭示的纤毛虫群落具有一致的空间分布模式,且均显示环境因子与地理距离是影响西北冰洋纤毛虫空间分布的重要因素;ⅲ)结合海水区和过渡区的叶绿素最大层（Deep Chlorophyll Maximum,DCM）样品分析表明,在较大环境梯度下（即从海水区、过渡区至融池区）,环境因素是最为强烈的影响因素;在较小环境梯度下（即从海水区至过渡区）,深度为控制纤毛虫群落结构和多样性的主要因素。