2002年，我国确定了“以信息化带动工业化”的战略思想，信息通讯与网络技术得到快速的发展与应用，这为政府采购改革提供了动力和技术支持，电子采购作为一种新的采购方式应运而生。我国政府电子采购是新生事物，还处于摸索阶段，在建设的过程中还有很多问题需要解决。政府责任和绩效的日趋公开、财政的约束硬化、公民知情权的高涨等因素，要求政府开展电子采购的绩效评估。但是目前政府电子采购绩效评估存在着绩效评估机制不完善、缺乏科学全面的电子采购系统绩效评价框架、绩效评估指标体系不科学等各种问题。因此，需要建立全面、科学和操作性强的政府电子采购绩效评价体系。通过绩效评估，及时客观的评价资金投入的有效性，总结电子化采购系统的建设、运营和管理的成功经验，可以指导我国的政府采购电子化建设。本文以政府绩效评估相关理论研究为基础，建立了政府电子采购绩效平衡计分卡模型，设计了评价指标体系。按照理论分析与实证分析相结合的研究方法，以重庆市为研究对象，对政府电子采购绩效评估做了深入的分析和研究。依据新公共管理理论的观点，将已经在企业成功运用的平衡计分卡理论引入到政府电子采购绩效评估当中；平衡计分卡追求财务与非财务、长期与短期、主观与客观、外部与内部之间的平衡，将平衡计分卡运用到政府电子采购绩效评估当中，绩效评估结果更加科学、全面和客观。根据政府电子采购的特点和公共部门的特征，对原平衡计分卡模型进行修正，建立了政府电子采购绩效评估平衡计分卡模型，从“成本效益”、“顾客满意度”、“内部提升”、“公共价值”四个维度建立评价指标体系，并运用熵值法和模糊综合评价方法进行定量分析。最后，以重庆市为研究对象，对政府电子采购绩效评估做了实证研究；重庆市政府电子采购绩效评估综合得分为67.67，政府电子采购处于较低的水平，建议从完善评估机制、建立政府电子采购绩效评估信息系统和培养专业人才等方面提高政府电子采购绩效水平。