文心兰AP3-like基因的克隆与表达分析研究

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被子植物的AP3家族属于MADS-box基因中的B功能基因,其在花器官形成和生殖发育中有重要的作用。为研究兰花MADS-box基因的表达与花器官发育之间的关系,以文心兰(Oncidium Milliongolds)为材料,本研究通过RT-PCR方法克隆到一个花发育相关的MADS-box基因,通过该基因在花芽不同发育时期和不同组织的表达模式,推测该基因对花器官形成所起的调控作用,为兰花花器官发育的分子调控机制进一步的研究奠定基础,为兰花分子育种提供理论依据。本研究主要结果如下:(1)通过RT-PCR分离得到OAP3基因cDNA的全长,该基因全长799bp,包括一个612bp的CDS框,编码一个长度为203个氨基酸的蛋白质。在GenBank登录(登录号:GU644447)。进化树分析表明OAP3属于花器官发育B类基因,但该基因却不存在B类基因C-端共有的结构域。(2)文心兰OAP3基因蛋白属于AP3-like基因家族中的paleoAP3系列,与其它物种相比,氨基酸序列比对发现该序列与蝴蝶兰PeMADS5的氨基酸序列同源性高达78%,与单子叶植物水稻MADS16和百合LMADS1的氨基酸序列同源性均为62%,明显高于与双子叶植物拟南芥AP3(50%)和金鱼草DEF(50%)的同源性。(3)OAP3基因编码的蛋白质推测其分子量为23661.1D,理论等电点为9.49。其中,碱性氨基酸占总氨基酸的18.23%,酸性氨基酸占总氨基酸的13.80%,疏水氨基酸占总氨基酸的33.00%,极性氨基酸占总氨基酸的34.97%。(4) qRT-PCR表达分析表明:从抽花开始,随花芽的生长,该基因相对表达丰度呈明显上升趋势;OAP3在萼片、花瓣、唇瓣、雄蕊、子房以及营养器官叶片和花茎中都表达。
其他文献
显性低酚棉是由单显性基因控制的无腺体性状,其应用于生产比双隐性无腺体基因具有更大的优越性:1)在杂交分离群体中识别容易,可以减少分离群体的样本容量,缩短该性状转移到不同背景中所需的世代数,加快育种进程;2)可防止隐性无腺体品系在大田生产中由于与有腺体棉的天然异交所造成的种子品质污染;3)在杂交制种中可作为标记性状——以显性无腺体的亲本作父本,F1幼苗凡是无腺体的必是杂交种,若是有腺体,则为假杂种,