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为了进一步了解我国绵羊起源、群体遗传结构、群体遗传关系，本研究利用线粒体DNA(mtDNA)标记分析了滩羊、苏尼特羊、迪庆羊、岗巴羊、浪卡子羊、豫西脂尾羊、内蒙古细毛羊、阿勒泰羊、多浪羊、大尾寒羊、晋中绵羊、蒙古羊(多角)羊等15个绵羊品种(群体)的遗传多样性和起源进化。利用PCR-SSCP技术检测绵羊线粒体ND5基因片段多态性，并基于PCR-SSCP结果测定了D-loop全序列和细胞色素B(Cytb)全序列，分别应用邻接法(NJ)和非加权成组配对法(UPGMA)构建系统发生树；同时进行了网络进化和群体扩张分析。采用29对微卫星标记分析了岗巴羊、浪卡子羊、豫西脂尾羊等16个绵羊品种(群体)的遗传变异，计算了群体的杂合度、等位基因数、遗传分化系数等，构建了品种聚类树。应用边际多样方法，分析了豫西脂尾羊、浪卡子绵羊、滩羊等24个品种(群体)的灭绝概率、品种贡献率、边际多样性和保护潜力，确定了优先保护次序和保护资金优化分配方案。形成如下结果：1．利用PCR-SSCP技术检测到我国绵羊群体存在三种单倍型，且我国绵羊群体以亚洲型(单倍型A)为优势单倍型；2．测定了15个绵羊群体114个个体的线粒体D-loop全序列，结果得到105个单倍型；基于D-loop全序列系统发育分析将我国绵羊聚为4个支系，其中支系D为新发现的支系；揭示我国家绵羊至少存在3个母系起源，摩佛伦羊与中国绵羊有较近的亲缘关系。经网络进化分析、Fu’S检验和核苷酸不配对分布曲线分析，A、B、C三个支系经历过群体扩张。3．测定了15个绵羊群体42个个体的线粒体Cytb基因全序列，结果得到40个单倍型；基于Cytb基因全序列系统发育分析同样将我国绵羊分为4个支系。4．群体遗传距离分析显示多角羊与普通绵羊距离较远。5．微卫星标记分析结果表明我国绵羊群体遗传多样性较丰富，多态信息含量(PIC)均值为0.698，平均杂合度(H)为0.74。6．基于DA距离构建的NJ聚类树将16个绵羊群体聚为4类，聚类结果与品种育成史、地理分布基本一致，但个别群体聚类结果难以从以上角度解释。7．若以保护潜力为依据，绵羊群体的优先保护次序为兰州大尾羊、汉中绵羊、滩羊、贵德黑裘皮羊、滩羊、豫西脂尾羊、多浪羊和腾冲绵羊等。8．比较分析了不同保护模型的保护效果，确定保护资金配额与有效群体成互作效应模型(即模型A)为保护资金配置最佳模型，具体投资分配方案为：多浪羊(8％)、腾冲绵羊(6％)、豫西脂尾羊(11％)、滩羊(3％)、兰州大尾羊(33％)、贵德黑裘皮羊(18％)和汉中绵羊(21％)。