我国自20世纪80年代末，引进产业、高校的合作教育开始，近些年来不断加大推进产学研合作的力度，取得了瞩目的成果。同时由于产学研合作的复杂性也出现了诸如：成本分摊不均、效率评价不明确、产学研合作稳定性差等问题。因此，近些年来产学研合作研究成为学术界研究的重点和热点问题。　　 本文通过引进生物学中共生理论，阐述了产学研合作共生系统中的产学研合作共生单元、3种产学研合作共生环境、4种产学研合作共生模式、产学研合作共生机理；针对现阶段我国产学研合作出现的成本分摊不均、效率评价不合理等阻碍产学研合作发展的因素，采用了将热力学中熵的概念引入到数据包络分析的方法，对产学研合作共生单元中（同类异代类型）的固定成本分摊进行了分析，选取安徽省某商业银行的实际数据进行了实证研究，证明此方法的科学性和可行性；同时运用了数据包络分析中的并联交互式评价模型，对我国产学研合作共生系统进行了科学的效率评价，为今后产学研合作效率评价提供了新方法和新思路；最后，针对产学研合作共生系统中出现的问题和可以改进方面，提出了体制创新、政策环境优化、建立风险投资机制、建立合理的固定成本分摊机制、健全国家产学研合作法律、法规和科技计划健全中介服务建立产学研合作公共服务平台、加强引导产学研合作共生模式选择等政策建议，为今后我国产学研合作发展提供了一定的决策支持。