基于RNA-Seq的雅致放射毛霉AS3.2778氨肽酶研究

来源 :华南理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuxuan_huang
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雅致放射毛霉(Actinomucor elegans),在我国是传统食品腐乳酿造加工中常见的优质菌种之一。该丝状真菌可分泌多种蛋白酶系,能较好地水解大豆蛋白等植物蛋白,对腐乳后期发酵过程中风味物质的形成起重要作用。由于该毛霉遗传背景不清晰,其蛋白酶系组成及相关基因都未有报道,限制了其蛋白酶分子水平的研究。本论文首次对麸皮固体培养基上培养48h的Actinomucor elegans AS3.2778进行基于RNA-Seq的转录组测序,得到其蛋白酶酶系的转录表达情况。对转录组数据分析发现,该菌转录组中共有蛋白酶基因106个,其中氨肽酶基因21个。论文进一步重点分析了该菌氨肽酶序列特征、家族分类以及进化关系,并通过实时荧光定量PCR实验和酶活测定实验分析比较了四个时间点氨肽酶的表达量和酶活差异情况,更好解释毛霉在不同生长时期需要产生相应的氨肽酶来满足自身的生长及生理需求。转录组数据显示,毛霉产生的氨肽酶共21种,分属于M1,M17,M24,S9等七个蛋白酶家族,其中大多数氨肽酶是金属蛋白酶。邻接法构建的系统进化树表明同一家族的蛋白酶往往聚在一个进化树枝上。毛霉形态学观察显示,其生长至第2天时菌丝体洁白且浓密,达到旺盛时期;电子显微镜观察结果表明毛霉从第2天开始产生孢子,且孢子数随着培养时间延长而增多。对第1d,2d,3d和4d四个时期的毛霉cDNA进行实时荧光定量PCR验证,发现5号基因(Genbank登录号为KP973585)在第3天的表达量是21种氨肽酶基因中最高的,且大部分基因在第3-4天的表达量达到最大值。第1d,2d,3d和4d的粗酶液酶活测定结果表明:在pH6.5和pH8.0条件下,毛霉粗酶液对所选的十种底物水解程度明显高于pH5.0和pH9.5条件下的水解程度。其中pH6.5时对底物Phe-pNA水解度最高,说明Phe-pNA是毛霉氨肽酶的最适底物,pH6.5是毛霉氨肽酶的最佳pH,且不同时间点的氨肽酶在不同pH条件下对同一底物的酶活也是有差异的。综合以上研究结果表明:雅致放射毛霉具有丰富的蛋白酶系,该菌在第2-3天长势旺盛,氨肽酶表达活跃,酶活相对较高,相关研究为进一步了解该菌的蛋白酶基因及其分子克隆等研究奠定了基础。
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