TNF-a是一类重要的细胞因子,由活化的巨噬细胞和T细胞产生,具有多种生理活性,主要参与炎症反应并能选择性地引起肿瘤组织坏死,有着广泛的临床应用前景。但临床的毒副作用限制了它的进一步应用。现有的研究结果表明,蛋白质的结构与功能有着密切的关系。生物信息学为我们提供了一条可以直接由基因或蛋白质序列进行蛋白质功能预测和结构预测的捷径。本文尝试利用生物信息学的方法和软件对肿瘤坏死因子的蛋白质序列进行研究比对,目的是找到序列和活性之间的联系,以期进一步指导人们合理有效地设计出高效低毒的hTNF-a衍生物,为hTNF-a应用于临床提供一条新路。通过对人肿瘤坏死因子h-TNFA氨基酸序列和与之有不同程度一致性的各物种的TNFA、TNFB、TNFC、CD40L、TNF10、TNF11、TNF13、TNF14等的氨基酸序列进行两两比对结果显示和文献报道的完全一致。此外还有一些新的发现：人肿瘤坏死因子氨基酸序列有一些高度保守的位点,其中102位和104位在文献里鲜有提及；保守性位点多集中于片层中的折叠股内,尤其集中在A4、A5和A3,其次是B2、B2和B3。突变位点多集中与连接折叠股的长环处,特别是在L3和L4内。转角处常非常保守,提示转角处残基有重要作用；人肿瘤坏死因子氨基酸序列N端前10个残基常发生突变,但8位在所有的TNFL6氨基酸序列中非常保守,没有发生任何突变。9位、10位常发生保守性突变。可以断定,人肿瘤坏死因子氨基酸序列中的保守位点和人肿瘤坏死因子的三维结构以及生物活性有着重要的联系。所有这些均证明利用生物信息学的方法研究蛋白质的氨基酸序列和结构、活性之间的联系是非常方便而又行之有效的方法。