水稻黑条矮缩病毒基因组片段S2的分子特性与S6的功能分析

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获得了水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarfvirus,RBSDV)湖北玉米分离物(Hbm)基因组片段2(S2)的全长cDNA克隆并测定了它的全序列.RBSDV-Hbm S2全长3813个碱基对,具有末端保守序列(+)5-AAGUUUU-AGCNNNNGUC-3,紧邻其末端保守序列,有一片段特异性的8个碱基的反向重复序列.S2编码链只含一个开放阅读框(open reading frame,ORF),编码一个由1226个氨基酸组成的蛋白,推测其分子量约为141.3kDa.序列同源性比较发现,RBSDV-Hbm S2与RBSDV浙江水稻分离物(Zjr)S2、Mal de Rio Cuarto virus(MRCV)S3、Fiji disease virus(FDV)S3和Nilaparvarta lugens reovirus(NLRV)S3编码蛋白的氨基酸序列同源性分别为99.7、84.4、58.0和23.2%.进化树分析表明RBSDV-Hbm与RBSDV-Zjr的关系最近,而与MRCV的关系近于与FDV和NLRV的关系.另外,构建了S2 ORF 5端部分的原核表达载体并在大肠杆菌中得到了表达.经IPTG诱导,在大肠杆菌中表达了RBSDV-S6编码的蛋白(P6),制备了相应的抗血清.Western blot分析结果显示,用P6的抗血清可在RBSDV侵染的玉米叶片和带毒的灰飞虱中检测到P6存在,而与纯化的RBSDV粒子蛋白不发生反应.此结果表明,RBSDV-Hbm S6编码的蛋白是一种非结构蛋白.
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