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目的:自2019年12月至2022年4月18日,全球已累积确诊COVID-19患者50399余万例,死亡621余万人。面对传染性如此强大的病毒,当下并无十分有效的治疗药物。新药的研发耗时长、成本高、安全性不明确,满足不了突发传染病患者用药的紧迫性。“旧药新用”则成为了一种解决上述问题的方法。本研究通过挖掘COVID-19转录组公开数据集,描述SARS-Co V-2所致的宿主分子反应,探讨COVID-19的发生发展过程,寻找COVID-19相关生物标志物和有价值的治疗靶点,筛选用于治疗COVID-19的潜在药物。为新冠的预防、治疗和控制提供依据,同时,也为今后未知疾病的出现提供一套药物筛选参考流程。方法:在GEO中以“COVID-19”“SARS-CoV-2”“2019-n Co V”等为关键词,以RNA-Seq为测序手段,以人类外周血液作为测序样本检索相关数据集;而后运用R语言的“DESeq2”R包进行差异表达分析,运用“WGCNA”包进行加权基因共表达网络分析,取差异表达基因集和新冠相关共表达基因集的交集得到差异共表达基因集;运用“cluster Profiler”包对差异共表达基因集进行KEGG/GO富集分析;将STRING网站与Cytoscape软件结合,构建PPI网络,使用Cytohubba插件筛选hub基因;将差异共表达基因列表输入Connectivity Map网站连接小分子药物扰动表达谱,获得COVID-19的潜在治疗药物。结果:1.根据检索标准,纳入“GSE152641”和“GSE152418”两个数据集进入后续分析;2.GSE152641数据集共得到2819个失调基因,GSE152418数据集共筛选得到2592个差异表达基因,与COVID-19最相关的共表达模块中包含837个基因,取三者交集共获得170个差异共表达基因;3.ADAMTS2、IFI27、METTL7B、OTOF、OLAH基因在两个数据集中皆为高度上调基因;4.差异共表达基因的KEGG富集分析结果显示,最显著富集的是“hsa04110细胞周期”信号通路。富集到的GO Terms的关键词为“有丝分裂”、“染色体分离”、“核分裂”、“着丝粒”、“解旋酶”等等;5.PPI网络中,排名Top 10 Degree的蛋白分别为CDK1、CDC20、CCNA2、CCNB2、CCNB1、AURKB、BUB1、BUB1B、PLK1、TOP2A;6.筛选到的TOP 10药物分别为依托泊苷、MG-262、喜树碱、椭圆玫瑰树碱、格列齐特、KPT-330、萘普索、帕博西尼、阿的平、鞣花酸。结论:1.SARS-CoV-2导致宿主细胞IFI27、ADAMTS2、METTL7B、OTOF、OLAH基因表达量增加;2.COVID-19的发生发展可能与细胞周期信号通路息息相关;3.CDK1、CDC20、CCNA2、CCNB2、CCNB1、AURKB、BUB1、BUB1B、PLK1、TOP2A这十个蛋白可能是调控COVID-19发病的核心蛋白,也可视为潜在治疗药物的靶点;4.依托泊苷、MG-262、喜树碱、椭圆玫瑰树碱、格列齐特、KPT-330、萘普索、帕博西尼、阿的平、鞣花酸是COVID-19的潜在治疗药物。