随着转基因技术的日新月异，转基因农产品的种类日益增多，社会对转基因质疑也越来越多，转基因农产品的安全性引起各国政府的高度重视。为了保障转基因农产品的质量，各国政府出台了一系列法规，建立转基因农产品溯源管理体系。同时随着WebGIS技术的快速发展，WebGIS技术在农产品溯源系统中发挥着越来越重要的作用。建立基于WebGIS的转基因农产品溯源系统，不仅可以有效控制转基因农产品质量安全，而且还能为我国设置贸易壁垒，保护本国农产品贸易。　　本文以浙江省舟山口岸转基因农产品为研究对象，建立了基于WebGIS的转基因农产品溯源系统，本系统开发采用B/S三层体系架构，溯源地图来自于ArcGIS Online，ArcGIS for Server10.2作为地图发布服务器，主要实现了以下四个功能。　　(1)转基因农产品的产地溯源:在参考商品编码和国际电话区号系统基础之上，制定了转基因农产品溯源编码体系。在溯源界面输入溯源码，即可查询该批次转基因农产品的相关信息列表，主要包括转基因作物插入事件的名称、外源基因、原产国、商品用途、运输工具、监控要求、检测方法以及检测报告等信息，并且能在ArcGIS Online地图中标注其原产地。　　(2)转基因作物基因风险评估:根据2012-2015年某口岸转基因农产品的检测数据，统计了转基因玉米、大豆、水稻及其制品中检出基因的频率，作为风险评估的依据。通过输入插入事件的名称，即可查询该插入事件的商业化国家、审批类型及年份、风险等级。　　(3)专题图的制作:以全球各国历年转基因大豆、玉米产量为依据，绘制了全球转基因大豆、玉米产量分布图，并且实现了全球各国转基因农产品图属信息的查询。　　(4)数据库查询:共收录18种作物种类120多条插入事件，50多条外源基因序列。通过该数据库，可以查询到插入事件基本信息、外源基因及外源蛋白表达信息、PCR检测反应信息、商业化审批信息、环境安全性评价信息、参考标准等信息，方便了实验室人员的查询。