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本研究利用青海农林科学院园艺所菊芋研发中心从各地收集的41份菊芋种质资源进行SRAP-PCR分子标记研究，基于SRAP数据并结合植物学性状，对菊芋不同种质资源的遗传多样性进行分析，实验结果如下：1、对41份菊芋资源2年内植物学形状进行调查统计，主要包括地上部分、地下部分性状。结果表明：41份菊芋资源块茎性状主要有：纺锤状、不规则瘤状、棒状、球形、楔形；块茎颜色主要有：紫色、紫红色、白色、粉红色；地上部份主要性状主要包括：叶色、叶形、绒毛等。2、建立了菊芋SRAP-PCR反应体系，20μL最佳反应体系：2μL10×PCR扩增缓冲液，2.5mmol/L Mg2+，0.24mmol/L dNTPs，0.25μmol/L正反引物，0.8UTaqDNA聚合酶和80ng模板DNA。从110对引物组合中最终筛选出扩增条带清晰、多态性好的22对SRAP引物组合。利用筛选出22对SRAP引物组合对41份菊芋资源进行SRAP-PCR扩增，然后对条带进行统计分析，建立0-1数据库。共扩增出160条清晰条带，其中多态性条带120条（75%）。扩增的DNA片段大小一般在200~3000bp之间。3、结合41份菊芋资源2年植物学性状数据与SRAP分子数据进行遗传多样性分析，利用160个条带建立遗传相似矩阵，经聚类分析构建亲缘关系树状图可知，41份菊芋资源的遗传距离分布在0.65~0.95之间，平均为0.80，在相似系数为0.72处出分割，可以把41份菊芋资源分成2大类。第1大类包括：青芋1号和W16；其余的为第2大类。在相似系数为0.80处划分，可将第2大类分为5个亚类。第一亚类包括：青芋2号、w06、w18、w30和青芋3号。第二亚类包括w09、w07、w24、w84、w64、w62、w66、s138、s150、w78、w79、w73、w69、w72和w32。第三亚类包括：w23、w26、w22、w75、w36、w40和w43。第四亚类包括：w50、w51、w61、w54、w19、w58、w02、w55、w59和w20。第五亚类包括：w12和w39。