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本文采用SSR标记技术,研究玉米杂交种亲本快速鉴定技术,分析玉米自交系之间的遗传变异及其来源,探讨自交系与其衍生系之间的遗传关系,从而为玉米品种鉴定和保护提供技术支撑。主要研究结果如下:(1)以17个自交系及其组配的10对正反交杂交组合为材料,探索出一套玉米籽粒种皮DNA快速提取方法,采用SSR标记验证了玉米籽粒种皮DNA与其母本一致,建立了玉米杂交种母本自交系的SSR快速鉴定技术体系。(2)通过对来源于不同地点、不同年代的我国10个骨干玉米自交系的SSR标记分析,发现来源于不同年代的同名自交系之间遗传变异非常小,遗传相似系数最小为0.944,平均相似系数为0.99;来源于不同地点的同一自交系之间变异也较小,遗传相似系数最小为0.923,平均相似系数为0.969。(3)针对黄早四×掖107和X178×B73两个群体的F2与相应的F2:8代的分子标记结果进行抽样调查,发现对于F8代母本与群体个体间相似系数,引物数≥20的标记结果与总标记数96对(黄早四×掖107)和总标记数85对(X178×B73)的结果没有显著差异,而用10对引物有显著差异;对于两个群体的F2代亲本与个体间和F8代亲本与个体间相似系数,引物数10～60的抽样结果与总标记结果没有显著差异,并且每次抽样统计的亲本与个体间的相似系数平均数之间没有显著差异。(4)利用黄早四×掖107和X178×B73两个群体的F2和F8代的分子标记结果计算出群体内个体与亲本之间的遗传相似系数并统计结果,发现相似系数小于0.75的概率占100%,群体内个体之间相似系数小于0.8的占100%,而两个群体中F2与F8对应上下代个体之间相似系数也小于0.8。通过10个不同地点来源不同年代的自交系计算出同名自交系之间最小相似性系数为0.923,而50份玉米自交系之间最大相似性系数达到0.853。二环系选出的个体与亲本之间的相似性系数都小于0.75。这表明采用二环系选出的新自交系与亲本系具有较大的遗传距离。