柑橘是我国第二大水果,现阶段,我国柑橘产业规模在不断扩大,产量持续提高,市场竞争也越来越激烈。同时,人们的生活质量在不断提高,对产品的质量要求越来越苛刻。优良的品种将在市场竞争中取得优势。本研究以广西柳城两个南丰蜜桔和华农基地的南丰蜜桔为材料,用AFLP、SRAP和IRAP等分子标记分析了它们之间DNA水平上的差别,进一步分析比较了多个地区南丰蜜桔(Citrus reticulata Blanco)的遗传关系。另外本研究还分析了一个柚子优良品种——马家柚(Citrus grandis(L.)Osbeck),鉴定其苗木纯度,为规模化生产提供帮助。具体研究结果如下：1、用游标卡尺测量华中农大和柳城产的南丰蜜桔三个优株叶片指标,它们叶形指数分别是2.57,1.7和2.31。2、以120对AFLP引物组合、156对SRAP引物组合与56对IRAP引物组合对华中农大和柳城产的三个南丰蜜桔材料进行鉴定,结果发现AFLP与IRAP分子标记没有区分出它们之间的遗传差异；SRAP引物组合中有6对可以鉴别出他们之间的差异。3、用18个SRAP引物组合对10个不同产地的南丰蜜桔进行鉴定,这些引物组合能区别他们之间的遗传差异。4、把回收的差异片段序列用BLAST与NCBI数据库比对,未找到相应的匹配序列。5、用SSR分子标记分析了马家柚与广丰当地主要栽培其他几个柚类品种,电泳结果发现马家柚有两种谱带类型,与现在我国其他主栽柚子品种存在明显差别。